Kinetic and molecular dynamics studies on the metal‐dependent folding of metallothionein (MT)
Notice bibliographique
Résumé
Metal‐induced chelation is the driving force for the folding of the α and β domains of MT, however, the exact mechanism is unknown. Elucidation of this mechanistic process extends beyond MT to encompass other metalloproteins that rely on metal coordination to achieve a properly folded conformation. In this study, kinetic measurements were made of the metallation reaction to the individual domains of MT using stopped‐flow (SF) spectroscopy. Metal coordination was monitored by UV absorption at 250 nm corresponding to the ligand‐to‐metal charge transfer of the cysteinyl sulfur to the Cd 2+ ion. The metallation reaction was complete within the 2 ms dead time of the instrument at low temperature (8 °C) and low concentration (1.25 μM). This fast rate of reaction was confirmed using SF‐circular dichroism spectroscopy on the α fragment of MT. Molecular modeling was used to investigate the behavior of the protein backbone upon demetallation and to search for stable peptide conformations in the metal‐free state. The molecular dynamics (MM3) calculations showed an increase in the number of H‐bonds upon sequential demetallation suggesting possible structural stabilization via a H‐bonding network. In addition, the MD calculations showed movement of the Cys side chains from the inside of the domain core when in the metallated state to the outside surface upon metal removal. Financial support provided by NSERC (equipment/operating to MJS and Post‐Graduate Scholarships A & D to KERD) and ADF at UWO.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».