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Enregistrement W3175466915 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.1087.12

Association of HER2 Ile655Val and Ala1170Pro polymorphisms with breast cancer prognosis factors

2013· article· en· W3175466915 sur OpenAlexaff
Daniela Furrer, Christian Laflamme, Marc‐André Côté, Louise Provencher, Frédéric Barabé, Simon Jacob, Christine St‐Pierre, Éric Demers, Rosemarie Tremblay‐LeMay, Corinne Nadeau‐Larochelle, Julie Lemieux, Caroline Diorio

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerOncologyMedicineInternal medicineGenotypingLymphovascular invasionCarcinogenesisCA15-3CancerGenotypeMetastasisBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human epidermal growth factor receptor‐2 (HER2) overexpression occurs in about 15% of human breast cancers and is a marker of poor survival. However, it is unclear if common HER2 polymorphisms are associated with breast cancer prognosis factors. This study aimed to evaluate the association between HER2 polymorphisms and breast cancer prognostic factors in non‐metastatic HER2‐positive breast cancer patients. Among 73 women, HER2 polymorphisms (Ile655Val and Ala1170Pro) were assessed using TaqMan assays in normal and tumor breast tissues. In normal breast tissue, the variant allele 1170Pro was associated with younger age ( P =0.007) and the presence of lymphovascular invasion ( P =0.06). Similar associations were observed when polymorphism was assessed in tumor breast tissue. No association was found between Ile655Val polymorphism and breast cancer prognostic factors. However, we observed a difference of Ile655Val or Ala1170Pro genotyping between normal and tumor breast tissues ( P =0.03 and P =0.01, respectively). These preliminary results suggest that HER2 Ile655Val and Ala1170Pro polymorphisms may play a role in breast carcinogenesis, but only Ala1170Pro polymorphism is associated with breast cancer prognostic factors in non‐metastatic HER2‐positive breast cancer patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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