Investigating adaptation in marine threespine stickleback (Gasterosteus aculeatus) recently isolated to Lost Lagoon, British Columbia
Notice bibliographique
Résumé
Reduction in the number of lateral plates in Threespine Stickleback (Gasterosteus aculeatus) that have colonized freshwater habitats is a well-studied case of parallel evolution. Parallel evolutionary events provide insight into the processes driving adaptation by highlighting the contribution of natural selection to evolutionary change. Most studies have focused on threespine stickleback populations that have been living in freshwater since widespread glacial melting 10,000 to 20,000 years ago. I recently identified a population of marine threespine stickleback that have been sequestered in Lost Lagoon, BC, Canada since 1916 providing an opportunity to examine evolution on a contemporary time scale. In this thesis, I test the hypothesis that threespine stickleback in Lost Lagoon have adapted genetically and phenotypically to freshwater conditions because of changes in selective pressures following isolation to Lost Lagoon. I conducted genetic and phenotypic comparisons between Lost Lagoon and nearby marine and freshwater populations in Madeira Park, BC. Genetic comparisons involved examining divergence between populations at the ectodysplasin A (Eda) locus, the major genetic control for the number of lateral plates, and calculating neutral genetic divergence using FST from Pooled Sequencing results. Phenotypic comparisons were performed by using microcomputed tomography (µCT) to generate three-dimensional skeletal models that were landmarked to quantify shape phenotype. Results suggest that stickleback in Lost Lagoon have undergone considerable evolutionary change on a relatively short timeline and are in the midst of evolution transition. I also demonstrated the usefulness of this population in testing mechanisms driving selection because of the variation in Eda present on a controlled genetic background by testing the hypothesis that adaptation to freshwater is driven by increased escape response performance. Escape responses were stimulated and filmed in wild fish from Lost Lagoon and in a F1 generation raised in the laboratory. Results suggest that Eda does not contribute to variation in the kinematic variables measured. Collectively, the research in this thesis illustrates that Threespine stickleback in Lost Lagoon appear to be in the midst of evolutionary transition but the mechanistic connection between this transition and the Eda locus remains elusive.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».