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Enregistrement W3175570004 · doi:10.11575/prism/38868

Investigating adaptation in marine threespine stickleback (Gasterosteus aculeatus) recently isolated to Lost Lagoon, British Columbia

2021· dissertation· en· W3175570004 sur OpenAlexaboutno aff
Aspen M. Kozak

Notice bibliographique

RevuePRISM (University of Calgary) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGasterosteusSticklebackAdaptation (eye)FisheryBiologyOceanographyFish <Actinopterygii>GeographyEcologyZoologyGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reduction in the number of lateral plates in Threespine Stickleback (Gasterosteus aculeatus) that have colonized freshwater habitats is a well-studied case of parallel evolution. Parallel evolutionary events provide insight into the processes driving adaptation by highlighting the contribution of natural selection to evolutionary change. Most studies have focused on threespine stickleback populations that have been living in freshwater since widespread glacial melting 10,000 to 20,000 years ago. I recently identified a population of marine threespine stickleback that have been sequestered in Lost Lagoon, BC, Canada since 1916 providing an opportunity to examine evolution on a contemporary time scale. In this thesis, I test the hypothesis that threespine stickleback in Lost Lagoon have adapted genetically and phenotypically to freshwater conditions because of changes in selective pressures following isolation to Lost Lagoon. I conducted genetic and phenotypic comparisons between Lost Lagoon and nearby marine and freshwater populations in Madeira Park, BC. Genetic comparisons involved examining divergence between populations at the ectodysplasin A (Eda) locus, the major genetic control for the number of lateral plates, and calculating neutral genetic divergence using FST from Pooled Sequencing results. Phenotypic comparisons were performed by using microcomputed tomography (µCT) to generate three-dimensional skeletal models that were landmarked to quantify shape phenotype. Results suggest that stickleback in Lost Lagoon have undergone considerable evolutionary change on a relatively short timeline and are in the midst of evolution transition. I also demonstrated the usefulness of this population in testing mechanisms driving selection because of the variation in Eda present on a controlled genetic background by testing the hypothesis that adaptation to freshwater is driven by increased escape response performance. Escape responses were stimulated and filmed in wild fish from Lost Lagoon and in a F1 generation raised in the laboratory. Results suggest that Eda does not contribute to variation in the kinematic variables measured. Collectively, the research in this thesis illustrates that Threespine stickleback in Lost Lagoon appear to be in the midst of evolutionary transition but the mechanistic connection between this transition and the Eda locus remains elusive.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,703
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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