MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3175596780 · doi:10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.520.2

SM22 is needed for actin‐rich structures formed by enteropathogenic <i>Escherichia coli</i> and <i>Listeria monocytogenes</i>

2018· article· en· W3175596780 sur OpenAlexafffund
Michael Dominic Chua, Kevin Jay Hipolito, Julian Solway, Julian A. Guttman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésListeria monocytogenesEnteropathogenic Escherichia coliActinBiologyMicrobiologyCell biologyListeriaBacteriaEscherichia coliBiochemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Food‐borne bacterial pathogens colonize the intestinal epithelia and cause various diseases. Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) remains extracellular and uses disease‐causing bacterial proteins to generate membrane‐bound actin protrusions on the host cell surface. These protrusions, called pedestals are crucial for disease and allow the bacteria to surf atop the intestinal epithelia ultimately leading to progressive changes to the tissue that cause diarrhea in the host. On the other hand, Listeria monocytogenes enters intestinal cells. Once within the cells these microbes initially form of branched networks of actin filaments around the bacterium called an actin cloud. These actin filaments then concentrate to one end of the microbe forming a comet tail that allows the bacterium to move within the host cell. L. monocytogenes can then use its comet tail to spread from cell‐to‐cell and infect various organs in the host. Through a previous mass spectrometry analysis of EPEC pedestals, we found that the actin bundling protein SM22 was concentrated through the full length of the pedestal. Because SM22 was enriched in EPEC pedestals, we then hypothesized that SM22 plays a crucial role in actin‐rich structures formed by both EPEC and other bacteria that hijack the actin filaments of the host during their disease processes. To test this, we initially used immunolocalization with L. monocytogenes infected cultured cells and found SM22 concentrated at L. monocytogenes actin clouds and comet tails. Using small interfering RNA, we depleted SM22 expression levels in host cells and found that fewer EPEC pedestals were able to form and less L. monocytogenes bacteria formed comet tails. The average comet tail length was also significantly shorter. As the reduction of SM22 diminished the abundance of actin‐rich structures generated by both EPEC and L. monocytogenes , we then determined if expressing EGFP‐tagged SM22 would increase the amount of EPEC pedestals and L. monocytogenes comet tails. Although EPEC pedestal formation was unchanged in cells overexpressing SM22, more comet tails were formed in L. monocytogenes ‐infected cells and those comet tails were longer. Taken together, EPEC pedestals and L. monocytogenes comet tails rely on SM22 for their formation and the disease process and identify SM22 as a target for regulating these infections. Support or Funding Information This study was funded through NSERC. This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetEscherichia coli research studies→Travaux en français237 207→