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Enregistrement W3175600579 · doi:10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.lb484

Ion Channel Activity in a 3‐hydroxyacyl‐coA dehydratase 1 (HACD1) Deficient Muscle Cell Line

2018· article· en· W3175600579 sur OpenAlexaboutno aff
Rhiannon Sarah Morgan, Gemma Walmsley, Steven Dyer, Fiona O’Brien, Caroline A. Staunton, Jordan Blondelle, Laurent Tiret, Richard J. Piercy, Richard Barrett‐Jolley

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyogenesisC2C12MyocyteIon channelBiologyMutationCell biologyPatch clampMyopathyInternal medicineEndocrinologyMolecular biologyGeneticsChemistryMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Centronuclear myopathy in Labrador retrievers is the most common inherited neuromuscular disorder in dogs: this is caused by a mutation in a fatty acid processing gene, HACD1. The mutation is carried by 15–20% of the breed worldwide (Pele et al., 2005). These dogs present with generalised progressive weakness. A congenital myopathy due to a HACD1 mutation has also been documented in a human family, where infants have hypotonia and delayed motor milestones (Muhammed et al., 2013). The cellular mechanisms by which HACD1 mutation lead to muscle weakness are unknown, but since fatty acids interact with membrane ion channels we hypothesised that dysregulation of membrane function could be involved. To investigate this we have used a muscle cell line (C2C12) with shRNA knock down (KD) of HACD1 in combination with ion channel gene qPCR and patch‐clamp electrophysiology. To quantify changes in C2C12 myogenic differentiation following HACD1 KD, we used a fusion index calculation on day 8 myotubes stained for the differentiation marker MF20 and counted nuclei that were present in MF20 positive myotubes against those that were in undifferentiated, MF20 negative cells. No significant difference in myotube fusion was observed in HACD1‐KD cells compared to control (n=2). Before beginning patch‐clamp studies on C2C12 cells we used qPCR to identify potential ion channel targets in control C2C12 myoblasts. We found expression of (<30ct) of 21 ion channels, including those of particular interest to calcium homeostasis such as the voltage‐gated Ca 2+ channels; Cacna1c, cacna1g, the non‐selective cation (NSC) channels; TRPV4, TRPV2, TRPC1 and a Ca 2+ ‐activated K + channel; Kcnn3. To functionally identify channel gating we used cell‐attached patch‐clamp electrophysiology of control and HACD1‐KD C2C12 myoblasts. K‐means clustering revealed five statistically significant clusters of ion channel activity in these cells ( p <0.05). Assuming an RMP of −15mV (Tanaka et al ., 2017) clusters had centeroids of;(i) conductance 21 ± 0.4pS, Vrev 30 ± 6mV (ii) 28 ± 6pS, −38 ± 4mV (iii) 29 ± 0.7pS, −78 ± 4mV (iv) 40 ± 6pS, 5 ± 3mV (v) 94 ± 13, 16 ± 44mV. In conclusion, the phenotype of the smallest ion channel conductance (28pS) would be consistent with the Ca 2+ ‐activated K + channel KCNN3, and the 94pS consistent with any of the three TRP channels identified by qPCR. These will be further characterised with pharmacological inhibitors and in the future we will examine if the populations change as the control and HACD1‐KD myoblasts differentiate into myotubes. Support or Funding Information Authors would like to thank J Blondelle & L Tiret from the Alfort Veterinary School for the cells used in these experiments. This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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