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Enregistrement W3175720080 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.1013.14

The abundance of the mRNA translation initiation inhibitor PDCD4 in L6 myotubes is regulated by mTORC1 and the proteasome

2012· article· en· W3175720080 sur OpenAlexafffund
Olasunkanmi John Adegoke, Dhanshri Kakade, Nushaba Islam

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésP70-S6 Kinase 1mTORC1eIF4AMyogenesisEIF4EEukaryotic initiation factorCell biologyInitiation factorBiologyTranslation (biology)MG132PhosphorylationChemistryMessenger RNABiochemistryProteasomeProteasome inhibitorMyocyteGeneProtein kinase B

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mammalian target of rapamycin complex 1/ S6 kinase 1 (mTORC1/S6K1) pathway is a critical regulator of muscle protein synthesis and mass. Using L6 myotubes, we characterized the regulation of the mRNA translation inhibitor programmed cell death 4 (PDCD4), a recently described substrate of the mTORCI/S6K1 pathway. Myotubes were cultured in amino acid‐free, serum‐free medium for 12 h, and then refed for 1 or 3 h. Starvation decreased the phosphorylation of S6K1, the PDCD4 kinase (P<0.01). Starvation increased the abundance, but not the phosphorylation, of PDCD4 >4 fold (P<0.001); refeeding reversed the effects of starvation on S6K1 and PDCD4. Rapamycin or MG132 (an inhibitor of the proteasome) prevented the refeeding‐associated decrease in PDCD4 abundance. Because PDCD4 inhibits translation by binding to the eukaryotic initiation factor 4A (eIF4A), we assessed this interaction. Starvation increased the % of PDCD4 bound to eIF4A (P<0.05); this was reversed during refeeding. Rapamycin prevented the effect of refeeding. Thus, we showed that in skeletal muscle cells, the abundance of PDCD4 and its interaction with the initiation factor eIF4A were reversibly modified by nutrients, and that the activities of mTORC1 and of the ubiquitin dependent proteolytic system were required for this regulation. Manipulation of PDCD4 abundance may offer an approach to stimulate mass. Funded by NSERC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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