AMP‐activated protein kinase (AMPK) activity in Leigh Syndrome French Canadian Type (LSFC) patient fibroblasts: differences between primary and immortalized cell lines
Notice bibliographique
Résumé
Background & Objective LSFC is an autosomal recessive disease caused by mutations in the leucine‐rich pentatricopeptide repeat containing protein (LRPPRC) gene resulting in decreased LRPPRC expression. This leads to a tissue‐specific cytochrome c oxidase deficiency and a reduction in energy production. AMPK is a key enzyme in the regulation of energy homeostasis. To test the hypothesis that AMPK activity may differ in LSFC and control cells, we evaluated the phosphorylated and active form of AMPK in primary (P) fibroblasts and, because of the limited availability of P cells, we also tested their immortalized (I) counterparts. Results Under basal conditions, P fibroblasts from LSFC patients and controls showed marginal differences in the levels of phosphorylated AMPK (pAMPK) as well as acetyl‐CoA carboxylase (ACC), one of many AMPK substrates. However, compared to P cells, I cells from both controls and LSFC patients showed a 60% and 80% decrease in pAMPK, respectively. Consistent with pAMPK levels, phosphorylated ACC levels were also decreased in I cells by 58 % in controls and 69% in LSFC patients. The total levels of these proteins were similar in all cases. Conclusion These results highlight an important decrease in AMPK activity level in I vs. P cells, which may compromise the capacity of these cells to palliate an energy deficit. Supported by: Association de l'acidose lactique and CIHR Emerging Team Grant
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».