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Enregistrement W3175733549 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.lb132

AMP‐activated protein kinase (AMPK) activity in Leigh Syndrome French Canadian Type (LSFC) patient fibroblasts: differences between primary and immortalized cell lines

2012· article· en· W3175733549 sur OpenAlexaffabout
Yvette Mukaneza, Marie-Ève Rivard, Christine Des Rosiers, Lise Coderre

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAMPKProtein kinase AEndocrinologyInternal medicinePhosphorylationCell cultureChemistryBiologyCell biologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background & Objective LSFC is an autosomal recessive disease caused by mutations in the leucine‐rich pentatricopeptide repeat containing protein (LRPPRC) gene resulting in decreased LRPPRC expression. This leads to a tissue‐specific cytochrome c oxidase deficiency and a reduction in energy production. AMPK is a key enzyme in the regulation of energy homeostasis. To test the hypothesis that AMPK activity may differ in LSFC and control cells, we evaluated the phosphorylated and active form of AMPK in primary (P) fibroblasts and, because of the limited availability of P cells, we also tested their immortalized (I) counterparts. Results Under basal conditions, P fibroblasts from LSFC patients and controls showed marginal differences in the levels of phosphorylated AMPK (pAMPK) as well as acetyl‐CoA carboxylase (ACC), one of many AMPK substrates. However, compared to P cells, I cells from both controls and LSFC patients showed a 60% and 80% decrease in pAMPK, respectively. Consistent with pAMPK levels, phosphorylated ACC levels were also decreased in I cells by 58 % in controls and 69% in LSFC patients. The total levels of these proteins were similar in all cases. Conclusion These results highlight an important decrease in AMPK activity level in I vs. P cells, which may compromise the capacity of these cells to palliate an energy deficit. Supported by: Association de l'acidose lactique and CIHR Emerging Team Grant

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,072

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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