The Effect of <i>Lactobacillus plantarum</i> BW2013 on The Gut Microbiota in Mice Analyzed by 16S rRNA Amplicon Sequencing
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Lactobacillus plantarum BW2013 was isolated from the fermented Chinese cabbage. This study aimed to test the effect of this strain on the gut microbiota in BALB/c mice by 16S rRNA amplicon sequencing. The mice were randomly allocated to the control group and three treatment groups of L. plantarum BW2013 (a low-dose group of 10 8 CFU/ml, a medium-dose group of 10 9 CFU/ml, and a high-dose group of 10 10 CFU/ml). The weight of mice was recorded once a week, and the fecal samples were collected for 16S rRNA amplicon sequencing after 28 days of continuous treatment. Compared with the control group, the body weight gain in the treatment groups was not significant. The 16S rRNA amplicon sequencing analysis showed that both the Chao1 and ACE indexes increased slightly in the medium-dose group compared to the control group, but the difference was not significant. Based on PCoA results, there was no significant difference in β diversity between the treatment groups. Compared to the control group, the abundance of Bacteroidetes increased in the low-dose group. The abundance of Firmicutes increased in the medium-dose group. At the genus level, the abundance of Alloprevotella increased in the low-dose group compared to the control group. The increased abundance of Ruminococcaceae and decreased abundance of Candidatus_Saccharimonas was observed in the medium-dose group. Additionally, the abundance of Bacteroides increased, and Alistipes and Candidatus_Saccharimonas decreased in the high-dose group. These results indicated that L. plantarum BW2013 could ameliorate gut microbiota composition, but its effects vary with the dose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».