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Enregistrement W3176043026 · doi:10.1016/j.cmpb.2021.106255

CRTpowerdist: An R package to calculate attained power and construct the power distribution for cross-sectional stepped-wedge and parallel cluster randomized trials

2021· article· en· W3176043026 sur OpenAlexafffund
Yongdong Ouyang, Liang Xu, Mohammad Ehsanul Karim, Paul Gustafson, Hubert Wong

Notice bibliographique

RevueComputer Methods and Programs in Biomedicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensCentre for Advancing Health OutcomesSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMichael Smith Health Research BC
Mots-clésStatisticsPoisson distributionRandomizationCluster (spacecraft)Randomized controlled trialStatistical powerRestricted randomizationMathematicsCluster randomised controlled trialComputer scienceBinary numberSample size determinationPower (physics)MedicineArithmeticSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The attained power, calculated conditional on the realized allocation, of a clinical trial may differ from the expected power, obtained pre-randomization through averaging over all potential allocations that could be generated by the randomization algorithm (RA). For example, a two-arm trial using a RA that is expected to allocate 20 participants to each arm will attain less than the expected power if by chance it allocates 25 and 15 participants to the arms. Cluster randomized trials with unequal cluster sizes have elevated risk of realizing an allocation that yields an attained power much lower than the expected power when modest numbers of clusters are randomized. METHOD: We developed the R package CRTpowerdist, which implements both simulations and approximate analytic formulae to calculate the attained powers associated with different realized allocations and constructs the pre-randomization power distribution associated with the RA to facilitate assessing the risk of obtaining inadequate power. The package covers unequal cluster-size, cross-sectional stepped-wedge and parallel cluster randomized trials, with or without stratification. Allowed outcome types are: continuous (Gaussian), binary (Binomial) and count (Poisson). The analytic formulae-based calculations are also implemented in a Shiny app. RESULTS: The functionality of the CRTpowerdist is illustrated for each type of trial design. The examples show how to obtain the attained power, the power distribution, and the risk of low attained power, using both simulation and analytic formulae. CONCLUSION: For cluster randomized trials with unequal cluster sizes, the CRTpowerdist package can assist users in identifying an appropriate randomization algorithm by enabling the user to assess the risk that a randomization algorithm will lead to an allocation with inadequate attained power. The Shiny app makes these assessments accessible to researchers who are unable or do not wish to use the CRTpowerdist package.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,037
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,286
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,391

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0370,286
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1170,032

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,412
Tête enseignante GPT0,580
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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