Modulation of Fe‐S cluster midpoint potential and electron transfer rates in <i>Escherichia coli</i> succinate dehydrogenase
Notice bibliographique
Résumé
Succinate Dehydrogenase (Sdh, Complex II) is an indispensable enzyme involved in the Krebs cycle as well as energy coupling in the mitochondria and certain prokaryotes. During enzyme turnover, succinate is oxidized to fumarate in the catalytic subunit (SdhA) and donates two electrons to a flavin adenine dinucleotide cofactor. The electrons are then shuttled singly through a series of iron‐sulfur (Fe‐S) clusters in SdhB until they reach the membrane anchor domain (SdhCD), where they reduce ubiquinone to ubiquinol. At the heart of the electron transport chain is a [4Fe‐4S] cluster (FS2) with a low midpoint potential ( E o ) that acts as an energy barrier against electron transfer. Hydrophobic residues around FS2 were mutated to determine their effects on Fe‐S cluster electrochemistry as well as electron transfer rates. SdhB‐I150E and SdhB‐I150H mutants lowered the E o of FS2; surprisingly, the His variant had a lower E o than the Glu mutant. Mutation of SdhB‐L220 to His had no effect, but mutation to Asp lowered the E o of FS2. More interestingly, converting SdhB‐L220 to Ser did not alter the electrochemistry of FS2 but instead lowered the E o of the [3Fe‐4S] cluster. To corroborate the E o changes in these mutants to enzyme function, numerous assays were performed. These included aerobic growth in succinate minimal media, anaerobic growth in glycerol‐fumarate minimal media, non‐physiological succinate:PMS‐MTT enzyme assay, physiological succinate:Q 0 enzyme assay, and heme reduction assay. In general, it was discovered that a decrease in E o of either the [4Fe‐4S] cluster or the [3Fe‐4S] cluster is accompanied by a decrease in the rate of enzyme turnover. This research is funded by the AHFMR and CIHR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».