The mRNA stability of regulators of mitochondrial biogenesis is inversely related to muscle oxidative capacity
Notice bibliographique
Résumé
The stabilization of mRNA permits a greater amount of mRNA to be translated into protein. Accordingly, the mRNA stability of nuclear genes encoding mitochondrial proteins may be an important regulatory pathway in striated muscle mitochondrial biogenesis. We hypothesized that the transcript stability of these genes is highly regulated in oxidative tissue, prompting rapid rates of mRNA turnover. The stability of nuclear-encoded mitochondrial transcription factor A (Tfam) and nuclear respiratory factor 2 (NRF-2) was assessed in extracts of fast-twitch white (FTW), fast-twitch red (FTR), slow-twitch red (STR) and heart muscle using in vitro decay assays. mRNA decay rates were highest in oxidative tissue, as evident by the 2.4-fold and 3.6-fold lower half-life for Tfam and NRF-2, respectively, in heart compared to low oxidative FTW muscle. This corresponded well to the high ratio of destabilizing:stabilizing RNA binding protein expression (AUF1 p42:HuR) found in heart muscle. Additionally, there was a greater abundance of the destabilizing GRE-binding protein CUGBP1 in cardiac tissue. These values parallel the observed rates of transcript decay. Thus, the half-lives of mRNAs encoding mitochondrial biogenesis regulator proteins are inversely related to oxidative capacity, and provide an additional means for the regulation of mitochondrial transcripts in oxidative tissue.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».