<i>DUSP1</i> gene polymorphisms are associated with obesityrelated metabolic complications and gene methylation levels in severely obese patients
Notice bibliographique
Résumé
DUSP1 is a member of the dual‐specificity phosphatase family involved in the regulation of innate immune function and inflammation. In a previous study, DUSP1 gene was found to be underexpressed in visceral adipose tissue from severely obese men with the metabolic syndrome. Objective To verify the association between DUSP1 polymorphisms, gene expression and methylation levels and obesity‐related metabolic complications. Methods Association of tagging SNPs (tSNPs) with obesity‐related complications was tested in a cohort of 1900 severely obese individuals. Impact of tSNPs on CpG site methylation and correlations between DNA methylation and gene expression were computed in a subset of 14 samples. Results Following adjustment for the effects of age, sex and BMI, heterozygotes for rs881150 had lower HDL‐cholesterol levels and homozygotes for rs13184134 and rs7702178 had increased fasting glucose levels. rs13184134 was associated with methylation levels of CpG sites located ~1800 bp upstream the transcription start site. Methylation levels for 3 CpG sites located in this region were inversely correlated with DUSP1 gene expression. Conclusion These results suggest that polymorphisms in DUSP1 modulate plasma glucose and HDL‐cholesterol levels in obese patients potentially through alterations of gene methylation and expression. Funding: CIHR
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».