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Enregistrement W3176507138 · doi:10.1096/fasebj.20.4.a204

CpG motifs in bacterial DNA evokes peroxynitrite signaling in human neutrophils

2006· article· en· W3176507138 sur OpenAlexafffund
János G. Filep, Driss El Kebir, Tarek Khreiss, Levente József

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPeroxynitriteCpG siteDNA methylationMolecular biologyDNAChemistryCpG OligodeoxynucleotideBiologyCell biologyGene expressionSuperoxideGeneBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial DNA is emerging as an important regulator of functions of human neutrophil granulocytes. Bacterial DNA contains short sequences of nonmethylated CpG dinucleotides (CpG‐DNA) that are recognized by TLR‐9. Evidence suggests that peroxynitrite (ONOO‐) may function as an intracellular signal for cytokine production in neutrophils. We investigated whether CpG‐DNA evokes ONOO‐ signaling in neutrophils. High purity (>99.9%) human neutrophils express TLR‐9 and respond to CpG‐DNA (0.2‐10 μg/ml), but not to thymus DNA, with secretion of IL‐8 and, to a considerably lesser extent, IL‐6. Methylation of cytosines in CpG‐DNA resulted in a complete loss of activity. CpG‐DNA‐induced IL‐8 mRNA expression and IL‐8 release were blocked by inhibitors of endosomal acidification and L‐NAME. CpG‐DNA evoked concomitant formation of superoxide and NO, coinciding with ONOO‐ formation (assessed by dihydrorhodamine oxidation and nitrotyrosine formation). RT‐PCR amplified endothelial NO synthase in neutrophils cultured with or without CpG‐DNA. CpG‐DNA evoked rapid mobilization of NF‐kB and c‐Fos to the nucleus that were attenuated by L‐NAME parallel with inhibition of IL‐8 mRNA expression. Pharmacological blockade of NF‐kB activation attenuated ~75% of CpG‐DNA‐evoked IL‐8 release. These results provide evidence that bacterial DNA and unmethylated CpG motifs in particular activate ONOO‐ signaling in neutrophils, underlying IL‐8 gene and protein expression through activation of NF‐kB and c‐Fos. (Supported by CIHR MOP‐64283).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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