MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3176550979 · doi:10.1096/fasebj.2019.33.1_supplement.374.4

Differential Expression of NRG1‐ERBB4‐PSEN1‐NUP98 (NEPN) Signaling Axis as Potential Blood‐Based Biomarkers for Viral Myocarditis

2019· article· en· W3176550979 sur OpenAlexafffund
Paul Hanson, Veena Lin, Bruce M. McManus

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Immunology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMichael Smith Health Research BCMyocarditis Foundation
Mots-clésMyocarditisWestern blotInflammationViral MyocarditisPathologyMedicineHeart failureImmunohistochemistryBiopsyDownregulation and upregulationImmunologyBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Myocarditis, inflammation of the myocardium, is a leading cause of unexpected heart failure in young adults, commonly attributable to viral infections. Myocarditis manifests in a wide range of clinical presentations, from asymptomatic to acute heart failure. The current gold standard for diagnosis relies upon invasive endomyocardial biopsy, requiring histopathological demonstration of inflammation with/without associated myocyte damage. Under these guidelines, diagnostic sensitivity in independent published studies is <30%. We have previously demonstrated that detection of biomarkers within the NEPN pathway (implicated in immune response and heart failure) significantly improved diagnostic sensitivity to ~80%, however, this approach still relies upon biopsy. Thus, in the present study, our aim is to develop a non‐invasive, blood‐based diagnostic assay for viral myocarditis by examining the NEPN signaling axis and their cleavage fragments during the evolution of myocarditis. Design HeLa cells and human induced pluripotent stem cell (iPSC)‐derived cardiomyocytes (CM) were CVB3‐ or sham‐infected. Western blot analysis and confocal microscopy were performed to determine the expression and subcellular localization of NEPN signaling axis proteins in tissue culture. In addition, tissue and blood from murine models of viral myocarditis (A/J and C57BL/6 mice) were collected at 4 dpi (viremic phase) and 5 to 8 dpi (acute phase), and were analyzed by Western blot analysis, IHC and IF to detect protein expression. Results NEPN proteins all show changes in expression and subcellular localization throughout the infection time course. NUP98 is upregulated and cleaved during infection. NRG1 is upregulated in both lysates and supernatants. ERBB4 co‐localizes at the cell membrane with the protease PSEN1. ERBB4 and NRG1 cleavage fragments are secreted and detected in both tissue culture supernatant and mouse plasma. In the plasma of the less susceptible C57BL/6 mice, ERBB4 and NRG1 cleavage fragments increase throughout the viremic and acute phases. However, in the highly susceptible A/J mice, ERBB4 and NRG1 cleavage fragments were not detected in the plasma until 6 dpi (acute phase), when they are highly upregulated as compared to C57BL/6 mice (p=0.001). Conclusion Differential expression, subcellular localization and cleavage fragments of NEPN signaling axis proteins were detected during the pathogenesis of viral myocarditis. These composite changes may be useful in the development of a blood‐based diagnostic. Support or Funding Information Dr. Hanson's research is supported by the Myocarditis Foundation and Michael Smith Foundation for Health Research This abstract is from the Experimental Biology 2019 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetViral Infections and Immunology Research→Travaux en français237 207→