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Enregistrement W3176661691 · doi:10.1096/fasebj.20.4.a94-c

Effects of streptozotocin‐induced diabetes on the expression of cardiac mitochondrial proteins revealed by proteomic analysis

2006· article· en· W3176661691 sur OpenAlexafffundabout
Roger W. Brownsey, Jerzy E. Kulpa, Violet G. Yuen, John H. McNeill

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésStreptozotocinMitochondrionCitric acid cycleKetone bodiesEnzymeDiabetes mellitusBiochemistryTrypsinMetabolismChemistryAmino acidEndocrinologyInternal medicineBiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Streptozotocin (STZ) induces insulin deficiency and profound changes in energy metabolism. Previous studies have addressed changes in specific enzyme activities in STZ‐diabetes. Here, we comprehensively analyze the expression of proteins in heart mitochondria using mass spectrometry. Rats were injected with a single dose of STZ (60 mg/kg) and after 12 weeks, hearts were removed and mitochondria purified by gradient centrifugation. Mitochondrial proteins were digested with trypsin and derivatized with a set of amino‐reactive iTRAQ tags. Peptides were analyzed by HPLC and tandem mass spectrometry. More than 300 mitochondrial proteins were consistently identified, based on the recognition of multiple peptide sequences. STZ diabetes led to wide‐ranging but selective changes in protein expression. Many enzymes associated with fatty acid metabolism were markedly up‐regulated in STZ diabetes. In contrast, enzymes of the citric acid cycle and the respiratory complex V were unaffected, while enzymes of amino acid and ketone metabolism, as well as components of respiratory complexes I‐IV were significantly repressed. These results reveal complex and coordinated control of multiple steps in each of several major blocks of cardiac mitochondrial metabolism during insulin deficiency. These studies were supported by grants from the Heart and Stroke Foundation and from the Canadian Institutes of Health Research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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