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Enregistrement W3176849359 · doi:10.1101/2021.06.30.21259343

Clonal hematopoiesis of indeterminate potential is associated with worse kidney function and anemia in a cohort of patients with advanced chronic kidney disease

2021· preprint· en· W3176849359 sur OpenAlexafffund
Caitlyn Vlasschaert, Amy J. M. McNaughton, Wilma M. Hopman, Bryan Kestenbaum, Cassianne Robinson‐Cohen, Jocelyn S. Garland, Sarah Moran, Rachel M. Holden, Matthew B. Lanktree, Michael J. Rauh

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensHamilton Health SciencesSt. Joseph’s Healthcare HamiltonPopulation Health Research InstituteImpactMcMaster UniversityQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Society of NephrologySanofi GenzymePhysicians' Services Incorporated FoundationKidney Foundation of CanadaSanofi
Mots-clésHazard ratioMedicineInternal medicineKidney diseaseRenal functionCohortProportional hazards modelAnemiaOncologyCreatinineConfidence intervalGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP) is an inflammatory premalignant disorder resulting from acquired genetic mutations in hematopoietic stem cells. CHIP is common in aging populations and associated with cardiovascular morbidity and overall mortality, but its role in chronic kidney disease (CKD) has not been investigated. Methods We performed targeted sequencing to detect CHIP mutations in a cohort of 87 adults with eGFR < 60 ml/min/1.73m 2 . Kidney function, hematologic, and mineral bone disease parameters were assessed cross-sectionally at baseline, and a total of 2,091 creatinine measurements and 3,382 hemoglobin measurements were retrospectively collected over the following 12-year period. Results At baseline, 20 of 87 (23%) cohort participants had CHIP detected. Those with CHIP had lower baseline eGFR (22.3 ± 11.2 vs. 28.2 ± 11.5 ml/min/1.73 m 2 , P = 0.04) in age- and sex-adjusted regression models. Individuals with CHIP had a 2.5–fold increased risk of incident 50% decline in eGFR or ESKD in a Cox proportional hazard model adjusted for age and sex (95% confidence interval, 1.3–4.7). The annualized rate of eGFR decline adjusted for age and sex was -2.3 ±1.1 ml/min/1.73m 2 per year in those with CHIP versus -1.6 ±0.5 ml/min/1.73m 2 per year in those without CHIP. Further, those with CHIP had lower hemoglobin at baseline (11.6 ± 0.3 vs. 12.8 ± 0.2 g/dL, P = 0.0003) and throughout the follow-up period despite a greater use of erythropoiesis-stimulating agents. Conclusion In those with pre-existing CKD, CHIP was associated with lower eGFR at baseline, faster progression of CKD, and anemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
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