Quantum mechanical/molecular mechanical studies of photophysical properties of fluorescent proteins
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Light‐responsive proteins are widely employed in bioimaging, for example, fluorescent proteins (FPs), which are comprised of a chromophore centered within a barrel‐shaped protein. FPs exhibit remarkable one‐ and multi‐photon absorption (1PA and MPA, respectively) in addition to their emissive properties. Over the last two decades, many types of quantum mechanical, molecular dynamics, and combined quantum mechanical/molecular‐mechanical (QM/MM) approaches have been employed in the study of the photophysics of FPs. Among the latter, QM/MM approaches have proven to be capable of capturing the strong correlation between FPs' light‐responsive properties and their chromophore–environment interactions. In particular, polarizable embedding QM/MM methods are gaining attention by reason of their outstanding performance in the computation of MPA in FPs. Herein, we discuss the outcomes of some of the investigations performed on the 1PA, MPA, and emissive features of FPs using QM/MM approaches. In addition, critical aspects of the use of QM/MM approaches to study FPs' 1PA and MPA features are described. To those researchers interested in starting to perform MPA computations for FPs using QM/MM methods, this review aims to be a compass to navigate among the relevant available literature. This article is categorized under: Electronic Structure Theory > Combined QM/MM Methods Structure and Mechanism > Computational Biochemistry and Biophysics
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle