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Enregistrement W3176954631 · doi:10.1002/cjce.24242

A semi‐empirical mathematical model to specify the <scp>pH</scp> of bicarbonate‐buffered cell culture medium formulations

2021· article· en· W3176954631 sur OpenAlexaffvenue
Tam T. Duong, James M. Piret, R. Robert Balcarcel

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Journal of Chemical Engineering · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreMichael Smith Health Research BCUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBayer HealthCare
Mots-clésCarbon dioxideTitrationBicarbonateChemistryBase (topology)ChromatographyChemical engineeringInorganic chemistryOrganic chemistryMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The carbon dioxide/bicarbonate system is routinely used as a buffer in mammalian cell culture medium. However, due to the continuous degassing of carbon dioxide and its dependence on temperature, it is difficult to achieve the target pH during preparation at ambient temperature and without control of dissolved carbon dioxide, and even more so at cell culture operating conditions. These problems were amplified when preparing multiple (e.g., 20) customized preparations of an in‐sourced proprietary medium during research and process development of mammalian cell culture systems. Thus, a mathematical model was created to specify the amount of acid or base to add during preparation so as to achieve the target pH of each medium at process conditions without having to do titration. The relationship between gaseous carbon dioxide and the dissolved carbon dioxide in the proprietary medium containing unknown species was specified using a modified Henry's law equation (as done in prior work). Further, to allow medium preparation without doing titration, the acid/base properties of the proprietary medium were fitted by a parameter related to its Net Medium Acids during specification of model parameters. A subset of the solutions was prepared and tested in bioreactors with controlled CO 2 flow to validate the model. Then, the model was used to assess the equivalence of the pHs of the customized medium formulations despite variations in pCO 2 that occurred during incubation and sampling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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