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Enregistrement W3176962166 · doi:10.1038/s41598-020-72648-6

Molecular tests support the viability of rare earth elements as proxies for fossil biomolecule preservation

2020· article· en· W3176962166 sur OpenAlexfundno aff
Paul V. Ullmann, Kristyn K. Voegele, David E. Grandstaff, R. D. Ash, Wenxia Zheng, Elena R. Schroeter, Mary H. Schweitzer, Kenneth J. Lacovara

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiquePaleontology and Evolutionary Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRowan UniversityJurassic FoundationConcordia University of EdmontonNational Science Foundation
Mots-clésDiagenesisTaphonomyRare-earth elementGeologyCretaceousPaleontologyRare earthChemistryBiologyMineralogy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rare earth element (REE) composition of a fossil bone reflects its chemical alteration during diagenesis. Consequently, fossils presenting low REE concentrations and/or REE profiles indicative of simple diffusion, signifying minimal alteration, have been proposed as ideal candidates for paleomolecular investigation. We directly tested this prediction by conducting multiple biomolecular assays on a well-preserved fibula of the dinosaur Edmontosaurus from the Cretaceous Hell Creek Formation previously found to exhibit low REE concentrations and steeply-declining REE profiles. Gel electrophoresis identified the presence of organic material in this specimen, and subsequent immunofluorescence and enzyme-linked immunosorbant assays identified preservation of epitopes of the structural protein collagen I. Our results thereby support the utility of REE profiles as proxies for soft tissue and biomolecular preservation in fossil bones. Based on considerations of trace element taphonomy, we also draw predictions as to the biomolecular recovery potential of additional REE profile types exhibited by fossil bones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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