Comparing various epithelial cell lines as <i>in vitro</i> models for <i>Francisella tularensis</i> non‐phagocytic infections
Notice bibliographique
Résumé
The potential bioterrorism agent Francisella tularensis subspecies tularensis ( F. tularensis ) causes the disease tularemia; if untreated the disease can result in up to 60% mortality. As an intracellular bacterium, F. tularensis invades and occupies non‐phagocytic epithelial cells of its host – a process critical to the development of disease. To study epithelial infections, many cell culture models have been developed; yet choosing a suitable model from the literature is challenging due to varied infection parameters and inaccurate assessments of intracellular bacterial loads. In our lab, we have developed an epithelial cell model using a murine surrogate of F. tularensis Francisella tularensis subspecies novicida ( F. novicida ) and the cultured hepatocyte cell line BNL CL.2. Since our model emulates the murine model of tularemia, we hypothesize BNL CL.2 cells will be more susceptible to F. novicida infection compared to other models currently present in the literature. We assessed 8 different models with the same parameters using antibiotic survival assays and an immunofluorescence strategy to label intracellular vs extracellular bacteria. We found that while COS‐7, CMT‐93, and HEK‐293 cell lines may be suitable for studying specific aspects of infection such as invasion or replication; overall, BNL CL.2 cells were the most appropriate cell line to study F. tularensis epithelial infections in vitro . Grant Funding Source : NSERC and CIHR
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».