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Enregistrement W3177070626 · doi:10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.15.4

The microtubule networks in lung epithelia are severed during <i>Klebsiella pneumoniae</i> infections

2018· article· en· W3177070626 sur OpenAlexafffund
Michael Dominic Chua, Ci‐Hong Liou, Alexander Constantine Bogdan, Hong T. Law, Kuo‐Ming Yeh, Jung‐Chung Lin, L. Kristopher Siu, Julian A. Guttman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Health Research InstitutesSimon Fraser University
Mots-clésMicrotubuleKlebsiella pneumoniaeBiologyMicrobiologyA549 cellPhenotypeCell biologyCytoskeletonPneumoniaGeneCellGeneticsEscherichia coliMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Klebsiella pneumoniae is an enteric bacterium known to cause pneumonia, urinary tract infections and pyogenic liver abscesses. Of these infections, patients who develop pneumonia have poor survival rates and alarming mortality rates of up to 44% in highly infected individuals. Many studies have focused on identifying bacterial components crucial to the disease process, but the underlying sub‐cellular mechanisms for disease progression have remained elusive. To begin to study these mechanisms, we assessed the cytoskeletal integrity of infected A549 lung epithelial cells and lung epithelia from infected C57Bl/6J mice. We found that the microtubule networks of the entire epithelia were either severed or fully disassembled even when there were no bacteria directly attached on the host cells. Since bacterial attachment was not necessary to cause microtubule disassembly, we hypothesized that a novel K. pneumoniae protein activates signalling cascades that target microtubule‐severing activity within these lung cells. To test this hypothesis, we first infected A549 cells with K. pneumoniae mutants deficient for known bacterially generated pathogenic proteins and found that none of those proteins triggered microtubule severing. Then, we created a genomic library of the entire K. pneumoniae genome. Out of the ~3000 known K. pneumoniae genes, we found that K. pneumoniae ytfL ( KP ytfL ) consistently triggered microtubule severing in infected A549 cells. Bioinformatic analysis showed that the C‐terminal domain of KP YtfL has a catalytic region that could activate host signalling cascades. We then sought to identify the host microtubule‐severing enzyme responsible for the epithelial cell phenotype. Through immunolocalization studies, we discovered that the katanin catalytic subunit A1 like 1 protein (KATNAL1) and the katanin regulatory subunit B1 protein (KATNB1) were at the precise sites of microtubule severing. To determine if KATNAL1 and KATNB1 were responsible for K. pneumoniae ‐induced severing, we deleted the gene for either KATNAL1 or KATNB1 in A549 cells using CRISPR. We then infected the cells and when all the infected wild type cells had disassembled microtubules, KATNAL1 and KATNB1‐deficient cells retained intact microtubules. Thus, KATNAL1 and KATNB1 contribute to the microtubule severing activity during K. pneumoniae infections. Taken together, our data indicates that KP YtfL is a novel protein effector that triggers the activation of KATNAL1 and KATNB1 to sever microtubules in infected lung epithelial cells. Through our study, we identified a novel bacterial mechanism to destabilize the microtubule networks of an entire epithelium through the activation of host cell microtubule severing enzymes. Support or Funding Information This study was funded by NSERC, Taiwan NHRI and SFU institutional funds. This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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