The role of F plasmid TraF and TrbB in stabilizing the conjugative apparatus
Notice bibliographique
Résumé
The role of two proteins, TrbB and TraF, encoded by the F plasmid, were investigated for their ability to affect F transfer protein localization and stability using cell fractionation by sucrose gradient sedimentation and immunoblot analyses. Bacterial conjugation mediates the horizontal transfer of genetic material throughout the microbial world. The F plasmid contains a transfer region that encodes a type IV secretion system (T4SS) necessary for conjugative pilus assembly and DNA transfer. The F‐type T4SS are considerably more complex than the P‐type systems because of the properties of pilus retraction and stable mating pair formation. The proteins that are specific to F‐T4SS are TraF, ‐G (C‐terminal domain), TraH, ‐N, ‐U, ‐W, TrbB, ‐C and‐I. TraG, ‐N and ‐U are important for mating pair stabilization and the remaining proteins are required for pilus assembly and retraction. Several F‐T4SS proteins are remarkable for their high cysteine content (TraN, TraU and TraH have 22, 10 and 6 cysteines, respectively). TraF and TrbB, have thioredoxin‐folds with TrbB, but not TraF, having a characteristic CxxC motif. Previously, we have shown TrbB has DsbC‐like activity and acts as a disulfide bond isomerase since, like DsbC, it can partially complement a dsbA mutation. Whereas TrbB is not essential for conjugation, TraF is required for pilus assembly and transfer, suggesting that it has a role in construction of the T4SS conjugative pore. Using antisera to the F‐T4SS proteins we demonstrate that traF and trbB mutations affect the stability of the T4SS complex, particularly TraH and TraV.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».