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Enregistrement W3177270416 · doi:10.1096/fasebj.25.1_supplement.lb77

Mitochondrial gene variant contributing to coronary artery disease

2011· article· en· W3177270416 sur OpenAlexafffund
Naif A. M. Almontashiri, Allen C. T. Teng, Hsiao‐Huei Chen, Brian Cheng, Mohammad A. Alam, Matthew Ta, Robert Roberts, Thomas Langer, Heidi M. McBride, Alexandre F.R. Stewart

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurological diseases and metabolism
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyProteaseGeneticsGenome-wide association studyGeneSingle-nucleotide polymorphismEnzymeBiochemistryGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genome‐wide association studies (GWAS) have identified genetic variants that are associated with the risk for coronary artery disease (CAD), but the functional significance of these loci has remained obscure. We identified a genetic variant associated with CAD risk that changes the sequence of a mitochondrial protease called paraplegin (SPG7) and confirmed this association by meta‐analysis of 14 GWAS including 22,000 CAD cases and 60,000 controls. The variant changes an arginine residue at position 688 to a glutamine residue in the protease domain of SPG7. Most mutations in SPG7 cause a loss of protease function leading to spastic paraplegia. Although the Gln688 variant was considered benign in terms of spastic paraplegia, we have evidence that it is in fact a protease gain‐of‐function variant. We observed a strong correlation between the presence of the variant allele and the level of mature active SPG7 in peripheral lymphocytes, as well in primary cultures of human aortic smooth muscles. Consistent with increased SPG7 protease activity, increased production of cytochrome c oxidase subunits, ATP synthesis, cell proliferation and ROS production were seen in cells stably expressing this variant. Our data suggest that this gain of function may also be detrimental to mitochondrial function with aging. Our study is the first to link a mitochondrial matrix AAA protease variant to the risk of CAD. (Supported by CIHR)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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