Mitochondrial gene variant contributing to coronary artery disease
Notice bibliographique
Résumé
Genome‐wide association studies (GWAS) have identified genetic variants that are associated with the risk for coronary artery disease (CAD), but the functional significance of these loci has remained obscure. We identified a genetic variant associated with CAD risk that changes the sequence of a mitochondrial protease called paraplegin (SPG7) and confirmed this association by meta‐analysis of 14 GWAS including 22,000 CAD cases and 60,000 controls. The variant changes an arginine residue at position 688 to a glutamine residue in the protease domain of SPG7. Most mutations in SPG7 cause a loss of protease function leading to spastic paraplegia. Although the Gln688 variant was considered benign in terms of spastic paraplegia, we have evidence that it is in fact a protease gain‐of‐function variant. We observed a strong correlation between the presence of the variant allele and the level of mature active SPG7 in peripheral lymphocytes, as well in primary cultures of human aortic smooth muscles. Consistent with increased SPG7 protease activity, increased production of cytochrome c oxidase subunits, ATP synthesis, cell proliferation and ROS production were seen in cells stably expressing this variant. Our data suggest that this gain of function may also be detrimental to mitochondrial function with aging. Our study is the first to link a mitochondrial matrix AAA protease variant to the risk of CAD. (Supported by CIHR)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».