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Enregistrement W3177293011 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.750.20

Post‐translational modification of matrix metalloproteinase‐2 by peroxynitrite

2008· article· en· W3177293011 sur OpenAlexaff
Adrian C. Nicolescu, Serena Viappiani, Andrew Holt, Richard Schulz

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeroxynitriteChemistryMatrix metalloproteinaseBiochemistryGlutathioneEnzymeIntracellularBiophysicsSuperoxideBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Matrix metalloproteinases (MMPs) are key enzymes in the development and remodeling of tissues. Disruption of the interaction between a conserved Cys residue in the propeptide domain and Zn 2+ in the catalytic site activates MMPs. Enhanced biosynthesis of peroxynitrite (ONOO‾) is implicated in heart failure and myocardial ischemia/reperfusion (I/R) injury, where activated MMP‐2 was shown to degrade important intracellular targets, e.g. troponin I (TnI), myosin light chain‐1 and α‐actinin. We investigated the mechanisms by which ONOO‾ may activate full length 72 kDa MMP‐2 in vitro. Challenging MMP‐2 with ONOO‾ resulted in a biphasic change in MMP‐2 activity, with low μM ONOO‾ increasing and high μM reducing its activity. Changes in the V max of the enzyme and no significant effect on the K M were observed using a synthetic fluorogenic substrate. Addition of glutathione (GSH) did not potentiate the effect of ONOO‾, but prevented the loss of MMP‐2 activity induced by higher concentrations of ONOO‾. Mass spectrometry analysis of the reaction of ONOO‾ with either MMP‐2 or synthetic peptide KPRCGNPDVANYNFFPR identified several structural modifications, including sulfhydryl oxidation and, in the presence of GSH, reversible glutathiolation of the critical Cys. These data suggest that ONOO‾ can modify the critical Cys of the propeptide domain in MMP‐2 and that may be responsible for its activation in the heart.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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