Studies of segmental isotope‐enriched apolipoprotein E3 N‐terminal domain
Notice bibliographique
Résumé
Gene knock‐out and transgenic experiments in mice have revealed that apolipoprotein E (apoE) is critically involved in the homeostatic maintenance of blood cholesterol levels via a low density lipoprotein receptor(LDLR)‐mediated interaction. Although the lipid‐free structure of the apoE3 N‐terminal (NT) region has been structurally well characterized, the lipid induced conformational change within the NT α‐helical region is less defined. In an attempt to further characterize the nature of the lipidated apoE3 NT helix 4 within the context of the native NT domain, a protein segmental isotopic labeling method was employed to study the protein using heteronuclear multidimensional NMR spectroscopy. A fusion protein comprised of a chitin binding domain, a Saccharomyces cerevisae intein domain and apoE NT residues 1‐111 was expressed and the apoE fragment was released from the column by a 2‐mercaptoethanesulfonic acid (MESNA)‐induced cleavage. ApoE3 NT 112‐183 fusion protein was expressed in 15 N and/or 13 C‐ enriched minimal media and isolated via a pH and temperature induced succinimide formation resulting in polypeptide chain cleavage. HPLC purified apoE3(1‐111) and apoE3(112‐183) proteins were ligated to generate the intact apoE3 NT segmentally‐labeled protein. Studies of this segmentally labeled protein provide insight into the mechanism of apoE‐LDLR interaction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».