Cytochrome P450 2C11 5′‐flanking region and promoter: regulation by aromatic hydrocarbons in vitro and in vivo
Notice bibliographique
Résumé
Aromatic hydrocarbons (AHs) elicit toxic and adaptive responses via the aryl hydrocarbon receptor (AHR). AHs suppress the transcription of the growth hormone‐regulated, male‐specific rat hepatic cytochrome P450 2C11 gene ( CYP2C11 ) via an unknown mechanism. We hypothesize that the in vivo suppression of CYP2C11 by AHs is mediated by the gene’s promoter and 5′‐flank. Following bioinformatic analysis of putative transcription factor (TF) binding sites, we cloned up to 10kb of the CYP2C11 5′‐flank into a promoterless luciferase plasmid. Deletion analysis of CYP2C11‐ luciferase reporter constructs showed that a region between −2.4kb and −1.3kb mediated a paradoxical induction by AHs, particularly in human HepG2 cells. In the context of a heterologous promoter, this region did not appear to possess enhancer activity. Since suppression may only occur in an environment containing an intact endocrine system and the full complement of TFs necessary for CYP2C11 regulation, our study is now focused on live rats. Preliminary in vivo studies using high‐volume tail vein injection to deliver plasmid to the liver of live rats demonstrated measurable basal luciferase activity in rat liver homogenates; AH‐induced luciferase activity was also observed using a positive control plasmid under AHR control. The effects of anesthesia and high‐volume tail vein injection on endogenous hepatic CYP2C11 and CYP1A1 mRNA levels in vehicle and AH‐treated rats were examined. Our novel CYP2C11 ‐luciferase constructs will be studied in live rats challenged with AHs to identify key regulatory sequences mediating CYP2C11 suppression. [Support: CIHR]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».