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Enregistrement W3178265456 · doi:10.1101/2021.07.13.452164

Turnover Regulation of the Rho GTPase Cdc42 by Heat Shock Protein Chaperones and the MAPK Pathway Scaffold Bem4

2021· preprint· en· W3178265456 sur OpenAlexfundno aff
Beatriz González, Paul J. Cullen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthUniversity of TorontoYale University
Mots-clésCDC42GTPaseCell biologyCell polarityBiologySignal transducing adaptor proteinSignal transductionScaffold proteinCellBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract All cells maintain an axis of polarity that directs the orientation of growth. Cell polarity can be reorganized during development and in response to extrinsic cues to produce new cell types. Rho GTPases are central regulators of cell polarity and signal-dependent cell differentiation. We show here that one of the best understood Rho GTPases, the highly conserved yeast Cdc42p, is turned over by members of the Heat Shock family of Proteins (HSPs). The Hsp40p chaperone, Ydj1p, was required for turnover of Cdc42p by the NEDD4 E3 ubiquitin ligase, Rsp5p, in the proteosome. Cdc42p turnover was regulated by HSPs at high temperatures, and in aging cells where the protein formed aggregates, implicating HSPs in Rho GTPase quality control. We also show that Cdc42p Q61L , which mimics the active (GTP-bound) conformation of the protein, was turned over at elevated levels by Ydj1p and Rsp5p. A turnover-defective version of Cdc42p Q61L led to multibudding phenotypes, implicating Cdc42 turnover in singularity in cell polarization. Cdc42p turnover also impacted MAP kinase pathway specificity. A pathway-specific scaffold, Bem4p, stabilized Cdc42p levels, which biased Cdc42p function in one MAPK pathway over another. Turnover regulation of Rho GTPases by HSPs and scaffolds provides new dimensions to the regulation of cell polarity and signal-dependent morphogenesis. Significance Statement Rho GTPases are switch-like proteins that govern major decisions in cell polarity and signaling in eukaryotes. We elucidate here a pathway that turns over the yeast Rho GTPase Cdc42p, which is mediated by the heat-shock family of proteins (HSPs) and the NEDD4-type E3 ubiquitin ligase Rsp5p. This finding provides a way for HSPs to exert their widespread effects on morphogenetic responses, phenotypic plasticity, and signaling pathways. We also found that turnover of an active version of Cdc42p is critical for modulating cell polarity. Cdc42p turnover also impacted its function in a pathway specific setting, as stabilization of Cdc42p by Bem4p (SmgGDS-type scaffold) influenced the activity of a specific MAPK pathway. HSPs may regulate Rho GTPase turnover in many systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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