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Enregistrement W3178411050 · doi:10.1158/1538-7445.am2021-3062

Abstract 3062: Proton irradiation sensitizes cancer cell lines with acquired radioresistance by exploiting differentially dysregulated DNA damage response (DDR) pathways

2021· article· en· W3178411050 sur OpenAlexaff
Pek Lim Chu, Eugenia L.L. Yeo, Dennis Poon, Ce-Belle Chen, Minqin Ren, Saumitra Vajandar, Dewi Susanti, Hong Qi Tan, Sung Yong Park, T. Osipowicz, Kwok Wai Lo, Stanley K. Liu, Khee Chee Soo, Melvin L.K. Chua

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiation Therapy and Dosimetry
Établissements canadiensSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRadioresistanceCancer researchDNA repairDNA damageCancerPI3K/AKT/mTOR pathwayBiologyChemistryMolecular biologyCell cultureDNASignal transductionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Radiotherapy (RT) is a primary treatment modality that is used in 50% of cancer patients. Clinically, tumor radioresistance poses a challenge to achieve complete anti-tumor response following conventional photon-RT. Diverse mechanisms have been proposed to underpin radioresistance. However, targeting these aberrant pathways to overcome tumor radioresistance remains a clinical challenge. Here, we investigate if proton beam therapy (PBT) invokes differential cellular responses compared to photon-RT in a broad panel of radioresistant (RR) cancer cell lines. We generated isogenic RR human cancer cell lines: 22Rv1 prostate cancer, FaDu hypopharyngeal cancer and C666-1 nasopharyngeal cancer, by exposure of respective wildtype (wt) to 90 Gy photon-RT (2 Gy x 45 fr). RR was confirmed by clonogenic survival, with surviving fraction ratio (SFRR/SFwt) at 1-4 Gy (range: 1.2-1.8). Whole exome sequencing (100x; Illumina NovaSeq) was performed to profile RR-associated mutational drivers. We performed transcriptomic and proteome profiling of cellular response such as non-homologous end-joining (NHEJ) and homologous recombination (HR) repair at 1-24 h after 4 Gy PBT (2.5 MeV, 2 Gy/min) and photon-RT (0.66 MeV, 0.716 Gy/min). At baseline, we found common mutations and differential activation of several pro-survival (Akt, mTOR), epithelial-mesenchymal transition (EMT) (PDGF, TGFb) and DNA repair pathways (ATM, BRCA1, NHEJ- and HR-associated) genes in RR- relative to wt-22Rv1. Post-photon-RT, we observed residual persistent DNA repair in wt-cell lines up to 48 h. In contrast, repair in RR-cell lines was more proficient, as shown by recovery of γH2AX, ATM-Chk2 within 6 h, with significant NHEJ activation (DNA-PKcs). Next, we observed that RR-cell lines were more sensitive to PBT than photon-RT (mean SF4Gy PBT/SF4Gy photon-RT = 0.61), with delayed DNA repair (γH2AX) observed up to 48 h, which may be attributed to the difficulty in repairing PBT-induced DNA damage. This phenomenon, seems to be primarily orchestrated by decreased NHEJ activation combined with diminished cell cycle checkpoint arrest (p21) and anti-apoptotic (bcl-2) signaling. Radiosensitization by PBT was however not observed in wt (mean SF4Gy proton/SF4Gy photon = 1.14), corroborated by gene and protein expression of DDR-related pathways. We observed dysregulation of multiple pathways relating to EMT and DNA repair in our panel of RR-cancer cell lines, compared to the wt-counterparts. Additionally, we show the potential for PBT to overcome radioresistance in these models by targeting the DNA repair machinery. Due to the high cost of PBT, precise patient stratification is needed to ensure that PBT is applied only to patients who benefit significantly from this procedure over photon-RT. Our preliminary data represents a proof-of-concept for feasibility of patient stratification to PBT. Citation Format: Pek Lim Chu, Eugenia L.L. Yeo, Dennis J.J. Poon, Ce-belle Chen, Minqin Ren, Saumitra Vajandar, Dewi Susanti, Hong Qi Tan, Sung Yong Park, Thomas Osipowicz, Kwok Wai Lo, Stanley K. Liu, Khee Chee Soo, Melvin Lk Chua. Proton irradiation sensitizes cancer cell lines with acquired radioresistance by exploiting differentially dysregulated DNA damage response (DDR) pathways [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2021; 2021 Apr 10-15 and May 17-21. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2021;81(13_Suppl):Abstract nr 3062.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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