Abstract LB065: Prostate cancer molecular immunophenotypes in biopsies with high vs average radiation sensitivity as predicted by post-operative radiation therapy outcomes (PORTOS) scores
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: The combination of radiation therapy and immunotherapy has emerged as an exciting field of research with the potential for significant clinical benefit. Using pre-treatment prostate biopsies from two clinical trials we explored the hypothesis that a validated gene expression signature of postoperative radiation therapy outcome score (PORTOS) is associated with differences in tumor molecular immunophenotype. In this study, we compared prostate tumors with high vs average PORTOS scores for expression of 32 molecular immunophenoscores that reflect cancer antigen profiles and the cellular composition of tumor infiltrating lymphocytes. Methods: Gene expression profiles were obtained from microdissected tumor tissue from 242 treatment naïve-prostate biopsy cores obtained from 92 patients enrolled in the University of Miami MAST (NCT02242773) and BLaStM (NCT02307058) clinical trials. For each biopsy the PORTOS score (PMID: 27743920) and 32 tumor molecular immunophenoscores (PMID: 28052254) were determined from Affymetrix Human Exon 1.0 ST microarray data using published methods. Results: 14% of the biopsy cores were predicted by the PORTOS signature to be more responsive to radiation therapy. Compared to the cores with average PORTOS scores, the “high PORTOS” biopsies showed a 2 fold or greater level of the tumor immunoactivation markers Act CD4, Act CD8, EC, HLA DPA1 and Tem CD8 and a 2 fold or lower level of the tumor immunosuppression markers MDSC, SC, TIM3 and T reg (Mann-Whitney P value of <0.0001 for all nine comparisons of medians). Discussion: Preliminary studies suggest that prostate cancers with PORTOS scores that predict greater sensitivity to radiation therapy also have immunophenotype profiles consistent with a higher level of overall immunogenicity. Citation Format: Sandra M. Gaston, Sanoj Punnen, Oleksandr Kryvenko, Alan Pollack, Elai Davicioni, Seagle Liu, Radka Stoyanova. Prostate cancer molecular immunophenotypes in biopsies with high vs average radiation sensitivity as predicted by post-operative radiation therapy outcomes (PORTOS) scores [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2021; 2021 Apr 10-15 and May 17-21. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2021;81(13_Suppl):Abstract nr LB065.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».