MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3178779923 · doi:10.1093/noajnl/vdab070.026

OPTC-5. Molecular signatures of podoplanin expressing glioblastoma cell subsets with putative role in cancer associated thrombosis and microthrombosis

2021· article· en· W3178779923 sur OpenAlexaff
Nadim Tawil, Rayhaan Bassawon, Brian Meehan, Laura Montermini, Dongsic Choi, Ali Nehme, Hamed S. Najafabadi, Yasser Riazalhosseini, Nicolas Jay, Claudia L. Kleinman, Tenzin Gayden, Cristiana Spinelli, Lata Adnani, Charles Couturier, Kevin Petrecca, Nada Jabado, Janusz Rak

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology Advances · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphatic System and Diseases
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalJewish General HospitalMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPodoplaninCancer researchMicrovesiclesPlatelet activationBiologyPlateletImmunologymicroRNAGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Vascular anomalies, including thrombosis, are a hallmark of glioblastoma (GBM) and an aftermath of dysregulated cancer cell genome and epigenome. Upregulation of podoplanin (PDPN) by cancer cells has recently been linked to an increased risk of venous thromboembolism in glioblastoma patients. Thus, regulation of this platelet activating transmembrane protein by transforming events and release from cancer cells into the circulation are of considerable interest. We took advantage of single-cell and bulk GBM transcriptome dataset mining and investigated the pattern of PDPN expression across several databases. Our analysis indicated that PDPN is expressed by distinct (mesenchymal) glioblastoma cell subpopulations and is downregulated by oncogenic mutations of EGFR and IDH1 genes, via changes in chromatin modifications (EZH2) and DNA methylation, respectively. Additionally, we utilized isogenic and stem GBM cell lines, xenograft models in mice, ELISA assays for PDPN, tissue factor (TF), platelet factor 4 (PF4) and clotting activation markers (D-dimer), and multicolor nano-flow cytometry to show that GBM cells exteriorize PDPN and/or TF as cargo of exosome-like coagulant extracellular vesicles EVs. We also documented an increase of platelet activation (PF4) or coagulation markers (D-dimer) in mice harboring the corresponding PDPN- or TF-expressing glioma xenografts, respectively. While PDPN was a dominant regulator of systemic platelet activation, co-expression of PDPN and TF impacted local microthrombosis. Our work suggests that distinct cellular subsets drive multiple facets of GBM-associated thrombosis and may represent targets for diagnosis and intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,687

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuro-Oncology AdvancesMême sujetLymphatic System and DiseasesTravaux en français237 207