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Enregistrement W3178795416 · doi:10.3389/fmars.2021.690607

Single-Turnover Variable Chlorophyll Fluorescence as a Tool for Assessing Phytoplankton Photosynthesis and Primary Productivity: Opportunities, Caveats and Recommendations

2021· article· en· W3178795416 sur OpenAlexaff
Nina Schuback, Philippe D. Tortell, Ilana Berman‐Frank, Douglas A. Campbell, Áurea Maria Ciotti, Emilie Courtecuisse, Zachary K. Erickson, Tetsuichi Fujiki, Kimberly H. Halsey, Anna E. Hickman, Yannick Huot, Maxime Y. Gorbunov, David Hughes, Zbigniew Kolber, C. Mark Moore, Kevin Oxborough, Ondřej Prášil, Charlotte Robinson, Thomas Ryan‐Keogh, Greg M. Silsbe, Stefan Simis, David J. Suggett, Sandy Thomalla, Deepa Varkey

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Marine Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeMount Allison UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhytoplanktonProductivityComputer scienceEnvironmental scienceComparabilityEcologyBiologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phytoplankton photosynthetic physiology can be investigated through single-turnover variable chlorophyll fluorescence (ST-ChlF) approaches, which carry unique potential to autonomously collect data at high spatial and temporal resolution. Over the past decades, significant progress has been made in the development and application of ST-ChlF methods in aquatic ecosystems, and in the interpretation of the resulting observations. At the same time, however, an increasing number of sensor types, sampling protocols, and data processing algorithms have created confusion and uncertainty among potential users, with a growing divergence of practice among different research groups. In this review, we assist the existing and upcoming user community by providing an overview of current approaches and consensus recommendations for the use of ST-ChlF measurements to examine in-situ phytoplankton productivity and photo-physiology. We argue that a consistency of practice and adherence to basic operational and quality control standards is critical to ensuring data inter-comparability. Large datasets of inter-comparable and globally coherent ST-ChlF observations hold the potential to reveal large-scale patterns and trends in phytoplankton photo-physiology, photosynthetic rates and bottom-up controls on primary productivity. As such, they hold great potential to provide invaluable physiological observations on the scales relevant for the development and validation of ecosystem models and remote sensing algorithms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,081
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,201
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,427

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0810,201
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,005
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0060,012
Science ouverte0,0090,004
Intégrité de la recherche0,0060,013
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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