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Enregistrement W3179316687 · doi:10.1136/sextrans-2021-sti.446

P424 Rapidly rising epidemic of African plasmid/blaTEM-1 in penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae from Guangdong, China

2021· article· en· W3179316687 sur OpenAlexaboutno aff
Xiaolin Qin, Heping Zheng

Notice bibliographique

RevuePoster presentations · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlasmidNeisseria gonorrhoeaeMicrobiologyBiologyMultilocus sequence typingTypingTetracyclineVirologyGeneGenotypeGeneticsAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Background</h3> Our previous study showed a recent increase in the incidence of African-type penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae (PPNG) in Guangdong, China. The aim of this study was to investigate the prevalence and molecular epidemiology of African plasmid in PPNG isolates in Guangdong in two time frames, 2013–2015 and 2018–2019. <h3>Methods</h3> A total of 864 isolates were collected in two cities in Guangdong. Minimum inhibitory concentrations (MICs) of seven antimicrobials were determined by the agar dilution method. The molecular epidemiological characteristics were determined by PPNG and tetracycline-resistant N. gonorrhoeae (TRNG) plasmids typing, Sanger sequencing of TEM β-lactamase (blaTEM) genes,NG_porB gene and N. gonorrhoeae multiantigen sequence typing (NG-MAST). <h3>Results</h3> Investigation by PCR showed that 31.02% (268/864) of the isolates were PPNG, of which 53.36% (143/268) contained the TRNG plasmid. The blaTEM genes of PPNG isolates were carried by African increased (18.42% to 66.67%), Asian decreased (81.58% to 28.89%), and Toronto/Rio increased (0 to 4%) plasmids. Further plasmid typing showed that PPNG isolates consisted of three major clusters, namely African plasmid/blaTEM-1 (128/268, 47.76%), Asian plasmid/blaTEM-135?(59/268, 22.01%), and Asian plasmid/blaTEM-1 (57/268,21.27%). The percentage of isolates with the blaTEM-1-carrying African plasmid as predominant plasmid increased significantly from 13.16%(5/38) in 2013 to 66.67%(60/90) in 2019. Among the isolates carrying the African plasmid possessing blaTEM-1, NG-MAST_sequence type (ST)5061, ST1927, ST17748 and NG_porB type 8, 13,11,12 were found to be the predominant STs in both periods, respectively, but which showed differences in two cities in two periods. <h3>Conclusions</h3> The proportion of African plasmid/blaTEM-1 PPNG has continuously increased since 2013, in association with clonal spread, which might contribute to the rising gonorrhoea epidemic in Guangdong. The possibility that African plasmid/blaTEM-1 was acquired requires careful follow-up and continuous monitoring of African plasmid/blaTEM-1 to ascertain whether it constitutes a step towards evolutionary change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,609
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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