P424 Rapidly rising epidemic of African plasmid/blaTEM-1 in penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae from Guangdong, China
Notice bibliographique
Résumé
Background Our previous study showed a recent increase in the incidence of African-type penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae (PPNG) in Guangdong, China. The aim of this study was to investigate the prevalence and molecular epidemiology of African plasmid in PPNG isolates in Guangdong in two time frames, 2013–2015 and 2018–2019. Methods A total of 864 isolates were collected in two cities in Guangdong. Minimum inhibitory concentrations (MICs) of seven antimicrobials were determined by the agar dilution method. The molecular epidemiological characteristics were determined by PPNG and tetracycline-resistant N. gonorrhoeae (TRNG) plasmids typing, Sanger sequencing of TEM β-lactamase (blaTEM) genes,NG_porB gene and N. gonorrhoeae multiantigen sequence typing (NG-MAST). Results Investigation by PCR showed that 31.02% (268/864) of the isolates were PPNG, of which 53.36% (143/268) contained the TRNG plasmid. The blaTEM genes of PPNG isolates were carried by African increased (18.42% to 66.67%), Asian decreased (81.58% to 28.89%), and Toronto/Rio increased (0 to 4%) plasmids. Further plasmid typing showed that PPNG isolates consisted of three major clusters, namely African plasmid/blaTEM-1 (128/268, 47.76%), Asian plasmid/blaTEM-135?(59/268, 22.01%), and Asian plasmid/blaTEM-1 (57/268,21.27%). The percentage of isolates with the blaTEM-1-carrying African plasmid as predominant plasmid increased significantly from 13.16%(5/38) in 2013 to 66.67%(60/90) in 2019. Among the isolates carrying the African plasmid possessing blaTEM-1, NG-MAST_sequence type (ST)5061, ST1927, ST17748 and NG_porB type 8, 13,11,12 were found to be the predominant STs in both periods, respectively, but which showed differences in two cities in two periods. Conclusions The proportion of African plasmid/blaTEM-1 PPNG has continuously increased since 2013, in association with clonal spread, which might contribute to the rising gonorrhoea epidemic in Guangdong. The possibility that African plasmid/blaTEM-1 was acquired requires careful follow-up and continuous monitoring of African plasmid/blaTEM-1 to ascertain whether it constitutes a step towards evolutionary change.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».