Deactivation of SARS-CoV-2 via Shielding of Spike Glycoprotein Using Carbon Quantum Dots: Bioinformatic Perspective
Notice bibliographique
Résumé
The interaction of the spike (S) glycoprotein of SARS-CoV-2 with angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) correlates with increased virus transmissibility and disease severity in humans. Two strategies may be considered for preventive or treatment purposes: the blockage of the ACE2 receptors or the shielding of receptor-binding domains (RBD) in the Sprotein of COVID-19, as well as the S2 cleavage site that is used by the furin enzyme of the host cells in the late phase of virus activation. Herein, the interaction of carbon quantum dots (CQDs) with the Sprotein of SARS-CoV-2 was investigated using molecular docking and molecular dynamics. CQD molecules were optimized by the HF/3-21G level of theory; the probable interactions between the CQDs with Sprotein were studied by blind docking mode, considering the Sprotein as the receptor and CQDs as ligands. Ethanol, folic acid, Favipiravir, two kinds of functionalized triangular hexagonal graphene, and four kinds of functionalized CQDs were studied on a comparative basis. The results show that OH and amine-functionalized CQDs tend to interact with three branches of Sprotein, especially RBD. The fact that they can block the S2 cleavage site leads to their potential use as a therapeutic agent.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».