MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3179857518 · doi:10.1038/s41586-020-2496-1

A single-cell transcriptomic atlas characterizes ageing tissues in the mouse

2020· article· en· W3179857518 sur OpenAlexaff
Nicole Almanzar, Jane Antony, Ankit S. Baghel, Isaac Bakerman, Ishita Bansal, Ben A. Barres, Philip A. Beachy, Daniela Berdnik, Biter Bilen, Douglas Brownfield, Corey J. Cain, Charles K. F. Chan, Michelle B. Chen, Michael F. Clarke, Stephanie D. Conley, Spyros Darmanis, Aaron Demers, Kubilay Demir, Antoine de Morrée, Tessa Divita, Haley du Bois, Hamid Ebadi, F. Hernán Espinoza, Matt Fish, Qiang Gan, Benson M. George, Astrid Gillich, Rafael Gómez-Sjöberg, Foad Green, Geraldine Genetiano, Xueying Gu, Gunsagar S. Gulati, Oliver Hãhn, Michael S. Haney, Yan Hang, Lincoln Harris, Mu He, Shayan Hosseinzadeh, Albin Huang, Kerwyn Casey Huang, Tal Iram, Taichi Isobe, Feather Ives, Robert C. Jones, Kevin S. Kao, Jim Karkanias, Guruswamy Karnam, Andreas Keller, Aaron M. Kershner, Nathalie Khoury, Seung K. Kim, Bernhard Kiss, William Kong, Mark A. Krasnow, Maya E. Kumar, Christin S. Kuo, Jonathan Y. Lam, Davis P. Lee, Song Eun Lee, Benoit Lehallier, Olivia Leventhal, Guang Li, Qingyun Li, Ling Liu, Annie Lo, Wan-Jin Lu, Maria Lugo-Fagundo, Anoop Manjunath, Andrew P. May, Ashley Maynard, Aaron McGeever, Marina McKay, M. Windy McNerney, Bryan D. Merrill, Ross J. Metzger, Marco Mignardi, Dullei Min, Ahmad N. Nabhan, Norma Neff, Katharine M. Ng, Patricia K. Nguyen, Joseph J. Noh, Roel Nusse, Róbert Pálovics, Rasika Patkar, Weng Chuan Peng, Lolita Penland, Angela Oliveira Pisco, Katherine S. Pollard, Robert Puccinelli, Zhen Qi, Stephen R. Quake, Thomas A. Rando, Eric Rulifson, Nicholas Schaum, Joe M. Segal, Shaheen S. Sikandar, Rahul Sinha, Rene Sit, Justin L. Sonnenburg, Daniel Staehli, Krzysztof Szade, Michelle Tan, Weilun Tan, Cristina M. Tato, Krissie Tellez, Laughing Bear Torrez Dulgeroff, Kyle J. Travaglini, Carolina Tropini, Margaret Tsui, Lucas Waldburger, Bruce M. Wang, Linda J. van Weele, Kenneth I. Weinberg, Irving L. Weissman, Michael N. Wosczyna, Sean M. Wu, Tony Wyss‐Coray, Jinyi Xiang, Soso Xue, Kevin A. Yamauchi, Andrew C. Yang, Lakshmi Yerra, Justin Youngyunpipatkul, Brian Yu, Fabio Zanini, Macy E. Zardeneta, Alexander Zee, Chunyu Zhao, Fan Zhang, Hui Zhang, Martin Jinye Zhang, Lu Zhou, James Zou

Notice bibliographique

RevueNature · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCanadian Institute for Advanced Research
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésAgeingTranscriptomeBiologyCell typeCellCell biologyComputational biologyGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 321
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revueNatureMême sujetSingle-cell and spatial transcriptomicsTravaux en français237 207