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Enregistrement W3180470416 · doi:10.3390/ijms22147434

Nrf2, the Major Regulator of the Cellular Oxidative Stress Response, is Partially Disordered

2021· article· en· W3180470416 sur OpenAlexafffund
Nadun C. Karunatilleke, Courtney S. Fast, Vy Ngo, Anne Brickenden, Martin L. Duennwald, Lars Konermann, Wing‐Yiu Choy

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics, phytochemicals, and oxidative stress
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésKEAP1Transcription factorRegulatorCell biologyOxidative stressCREBProtein–protein interactionBiologyCarcinogenesisChemistryGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nuclear factor erythroid 2-related factor 2 (Nrf2) is a transcription regulator that plays a pivotal role in coordinating the cellular response to oxidative stress. Through interactions with other proteins, such as Kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), CREB-binding protein (CBP), and retinoid X receptor alpha (RXRα), Nrf2 mediates the transcription of cytoprotective genes critical for removing toxicants and preventing DNA damage, thereby playing a significant role in chemoprevention. Dysregulation of Nrf2 is linked to tumorigenesis and chemoresistance, making Nrf2 a promising target for anticancer therapeutics. However, despite the physiological importance of Nrf2, the molecular details of this protein and its interactions with most of its targets remain unknown, hindering the rational design of Nrf2-targeted therapeutics. With this in mind, we used a combined bioinformatics and experimental approach to characterize the structure of full-length Nrf2 and its interaction with Keap1. Our results show that Nrf2 is partially disordered, with transiently structured elements in its Neh2, Neh7, and Neh1 domains. Moreover, interaction with the Kelch domain of Keap1 leads to protection of the binding motifs in the Neh2 domain of Nrf2, while the rest of the protein remains highly dynamic. This work represents the first detailed structural characterization of full-length Nrf2 and provides valuable insights into the molecular basis of Nrf2 activity modulation in oxidative stress response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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