Abstract 1676: A comprehensive whole blood CyTOF immune monitoring panel with expanded surface and intracellular markers using the Maxpar Direct Immune Profiling Assay
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In-depth monitoring of the immune response to cancer and infection is vital to ascertain disease status and to assess immunotherapeutic options. Time-of-flight technology, the basis of CyTOF® mass cytometry, enables multiplex proteomic cellular phenotyping with 50 or more markers, making it ideal for comprehensive immune profiling. Unlike fluorescence-dependent approaches, which require signal compensation that makes the development of larger panels more challenging, CyTOF utilizes monoisotopic metal-tagged antibodies that exhibit minimal background signal, enabling the highest-resolution multiparametric landscape of a single cell. The Maxpar® Direct™ Immune Profiling Assay™ is a pre-titrated dried-down 30-antibody cocktail preparation for immune profiling of human whole blood or PBMC. This assay is used with Maxpar Pathsetter™ software, which resolves whole blood into 37 immune populations comprising major lineage populations and their subsets, such as CD4 Th subsets and B and T cell memory cells, as well as stratifications of myeloid populations. The resulting system is a simple sample-to-answer solution for immune monitoring studies. Here, we expanded the 30-marker assay with 14 additional antibodies comprising pertinent targets of immunotherapy, including the exhaustion markers PD-1, PD-L1, Tim-3 and CTLA-4, and co-stimulation markers 4-1BB and ICOS. We also demonstrated the compatibility of the assay with downstream intracellular staining for cytoplasmic markers IFN-γ, TNF-α, IL-2, perforin and granzyme B for assessment of cellular function in 4h PMA/ionomycin-stimulated whole blood cultures. Next, we modified the existing Pathsetter model to automate the analysis of whole blood stained with the expanded panel to generate reports on key immune cell populations, percentages of exhausted cells and cell subsets producing cytokines. Last, to demonstrate the ability of this expanded panel to identify antigen-specific T cell subsets accompanied by their in-depth phenotypic assessment, we tested this panel against CMV peptide-stimulated whole blood samples. We demonstrated the flexibility of the Maxpar Direct Immune Profiling Assay in panel customization and a streamlined workflow for automated analysis to enable comprehensive immune profiling of human whole blood. For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. Citation Format: Shariq Mujib, Stephen K. Li, Nick Zabinyakov, Christina Loh. A comprehensive whole blood CyTOF immune monitoring panel with expanded surface and intracellular markers using the Maxpar Direct Immune Profiling Assay [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2021; 2021 Apr 10-15 and May 17-21. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2021;81(13_Suppl):Abstract nr 1676.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».