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Enregistrement W3180876344 · doi:10.1093/bioinformatics/btab292

Expected 10-anonymity of HyperLogLog sketches for federated queries of clinical data repositories

2021· article· en· W3180876344 sur OpenAlexafffund
Ziye Tao, Griffin M. Weber, Yun William Yu

Notice bibliographique

RevueBioinformatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiquePrivacy-Preserving Technologies in Data
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteDivision of Mathematical SciencesUniversity of Toronto
Mots-clésAnonymityComputer scienceConfidentialitySketchProbabilistic logicAggregate (composite)SortingProtocol (science)Code (set theory)Information retrievalData miningComputer securityAlgorithmProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MOTIVATION: The rapid growth in of electronic medical records provide immense potential to researchers, but are often silo-ed at separate hospitals. As a result, federated networks have arisen, which allow simultaneously querying medical databases at a group of connected institutions. The most basic such query is the aggregate count-e.g. How many patients have diabetes? However, depending on the protocol used to estimate that total, there is always a tradeoff in the accuracy of the estimate against the risk of leaking confidential data. Prior work has shown that it is possible to empirically control that tradeoff by using the HyperLogLog (HLL) probabilistic sketch. RESULTS: In this article, we prove complementary theoretical bounds on the k-anonymity privacy risk of using HLL sketches, as well as exhibit code to efficiently compute those bounds. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: https://github.com/tzyRachel/K-anonymity-Expectation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,077
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesScience ouverte
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,844
Score d'incertitude au seuil0,992

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,077
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0130,044
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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