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Enregistrement W3181405059 · doi:10.1158/1538-7445.am2021-2500

Abstract 2500: The Forkhead-like protein Dach1 governs sensitivity to WEE1 kinase and PARP inhibitors

2021· article· en· W3181405059 sur OpenAlexaff
Zhiping Li, Xuanmao Jiao, A. Gordon Robertson, Anthony W. Ashton, Andrew V. Kossenkov, Hao Chen, Lai Yee Phoon, Li Lan, Richard G. Pestell

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyKu70DNA repairGeneticsChromatinMolecular biologyCancer researchGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Molecular analysis of all cancer types in the cancer genome atlas (TCGA) demonstrated that multiple pathways may be disrupted within a given tumor including PCa. Prostate cancer (PCa), the second leading cause of death in American men, includes distinct genetic subtypes with distinct therapeutic vulnerabilities. Substratification of PCa into genetic subtypes, forms the basis of rational therapy for PCa. Known genetic drivers to PCa include deletions of target genes (PTEN and NKX3.1 deletions), rearrangements/fusions of multiple genes (including TMPRSS2 and the oncogenic ETS transcription factor, ERG) and genetic predisposing factors (including germline DNA-repair gene mutations). An increasingly common finding in PCa are defects in DNA repair. The Drosophila Dac gene was initially cloned as dominant inhibitor of Elipse. The human homologue, DACH1, encodes a winged helix/Forkhead DNA-binding protein that binds in chromatin to FOXM1 sites. Herein, reduced expression of DACH1 is shown in PCa, correlating with DACH1 promoter methylation. Homozygous deletion of DACH1 occurred in up to 18% of human PCa, associated with increased AR activity, increased somatic copy-number alteration and poor prognosis. DACH1 increased DNA repair, as shown in comet assays, enhancing nonhomologous end joining (NHEJ) while reducing homology directed repair (HDR) in DNA repair reporter assays. Laser wounding showed DACH1 was recruited to sites of DNA damage, augmenting the recruitment of Ku70/Ku80. In Dach1 deletion cells reduced expression of Dach1 was associated with resistance to inhibitors of Poly-(ADP)-ribose polymerase (PARP) and enhanced sensitivity to inhibitors of WEE1 kinase and DNA-PK. The abundance of DACH1 in prostate cancer may define a subclass of prostate cancer warranting selective therapies. Citation Format: Zhiping Li, Xuanmao Jiao, A. Gordon Robertson, Anthony W. Ashton, Andrew Kossenkov, Hao Chen, Lai Yee Phoon, Li Lan, Richard G. Pestell. The Forkhead-like protein Dach1 governs sensitivity to WEE1 kinase and PARP inhibitors [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2021; 2021 Apr 10-15 and May 17-21. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2021;81(13_Suppl):Abstract nr 2500.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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