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Enregistrement W3181684306 · doi:10.1016/j.jtocrr.2021.100212

A Pan-Canadian Validation Study for the Detection of EGFR T790M Mutation Using Circulating Tumor DNA From Peripheral Blood

2021· article· en· W3181684306 sur OpenAlex
Shamini Selvarajah, Sophie Plante, Marsha Speevak, Andrea K. Vaags, Darren Hamelinck, Martin Butcher, M. Elizabeth McCready, Daria Grafodatskaya, Normand Blais, Danh Tran‐Thanh, Xiaoduan Weng, Rami Nassabein, Wenda Greer, Ryan N. Walton, Bernard Lo, Doug Demetrick, Stephanie Santos, Bekim Sadiković, Xiao Zhang, Tong Zhang, Tara Spence, Tracy Stockley, Harriet Feilotter, Philippe Joubert

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJTO Clinical and Research Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensQueen's UniversityKingston Health Sciences CentreLondon Health Sciences CentreUniversity of CalgaryUniversity Health NetworkOttawa HospitalUniversité LavalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalHamilton Regional Laboratory Medicine ProgramQueen Elizabeth II Health Sciences CentreInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecTrillium Health CentreAstraZeneca (Canada)McMaster UniversityDalhousie UniversityHamilton Health SciencesWestern UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesRocheAstraZeneca CanadaAstraZenecaPfizer
Mots-clésT790MConcordanceDigital polymerase chain reactionMutationMedicineResistance mutationPolymerase chain reactionOncologyInternal medicineBiologyGeneticsGeneKRASReverse transcriptase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: T790M resistance mutation in patients with advanced NSCLC with resistance to EGFR inhibitors. To facilitate standardization and clinical adoption of ctDNA testing across Canada, we developed a 2-phase multicenter study to standardize T790M mutation detection using plasma ctDNA testing. METHODS: variants and concordance with a clinically validated test at the reference laboratory. RESULTS: All laboratories in phase 1 detected the variants at 0.5 % and 5.0 % allele frequencies, with no false positives. In phase 2, the concordance with the reference laboratory for detection of both the primary and resistance mutation was high, with next-generation sequencing and droplet digital polymerase chain reaction exhibiting the best overall concordance. Data also suggested that the ability to detect mutations at clinically relevant limits of detection is generally not platform-specific, but rather impacted by laboratory-specific practices. CONCLUSIONS: Discrepancies among sending laboratories using the same assay suggest that laboratory-specific practices may impact performance. In addition, a negative or inconclusive ctDNA test should be followed by tumor testing when possible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,977

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,171
Tête enseignante GPT0,501
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle