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Enregistrement W3182281327 · doi:10.1212/wnl.0000000000012426

Status and Recommendations for Incorporating Biomarkers for Cutaneous Neurofibromas Into Clinical Research

2021· article· en· W3182281327 sur OpenAlexfundno aff
Deeann Wallis, Anat Stemmer‐Rachamimov, Sarah Adsit, Bruce R. Korf, Dominique C. Pichard, Jaishri O. Blakeley, Kavita Y. Sarin

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurofibromatosis and Schwannoma Cases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAssistance publique-Hôpitaux de ParisYork UniversityUniversity of MinnesotaChildren's Tumor FoundationNational Cancer InstituteCincinnati Children's Hospital Medical CenterDamon Runyon Cancer Research Foundation
Mots-clésClinical trialMedicineBiobankBiomarkerNeurofibromatosisBioinformaticsPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To summarize existing biomarker data for cutaneous neurofibroma (cNF) and to inform the incorporation of biomarkers into clinical trial design for cNFs. METHODS: The cNF working group, a subgroup of the Response Evaluation in Neurofibromatosis and Schwannomatosis (REiNS) consortium, was formed to review and inform clinical trial design for cNFs. Between June 2018 and February 2020, the cNF working group performed a review of existing data on genetic biomarkers for cNFs in the setting of neurofibromatosis type 1. We also reviewed criteria for successful biomarker application in the clinic. The group then held a series of meetings to develop a consensus report. RESULTS: Our systematic literature review of existing data revealed a lack of validated biomarkers for cNFs. In our report, we summarize the existing signaling, genomic, transcriptomic, histopathologic, and proteomic data relevant to cNF. Finally, we make recommendations for incorporating exploratory aims for predictive biomarkers into clinical trials through biobanking samples. CONCLUSION: These recommendations are intended to provide both researchers and clinicians with best practices for clinical trial design to aid in the identification of clinically validated biomarkers for cNF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,405
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,600
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,405
Score d'incertitude au seuil0,734

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,4050,600
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,012
Bibliométrie0,0110,010
Études des sciences et des technologies0,0040,009
Communication savante0,0130,022
Science ouverte0,0120,010
Intégrité de la recherche0,0220,025
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,128
Tête enseignante GPT0,429
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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