Distribution of HPV genotypes among women with abnormal cytology results in Alberta, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Background: Persistent infection with a subset of human papillomavirus (HPV) genotypes can cause abnormal cytology and invasive cervical cancer. This study examines the circulating HPV genotype strains in a local population of the province of Alberta (a largely unvaccinated population) to establish baseline frequency of vaccine and non-vaccine genotypes causing abnormal cervical cytology. Method: Remnant liquid-based cytology specimens from the Alberta Cervical Cancer Screening Program (March 2014–January 2016) were examined. Only specimens from women who had a cytology grading of atypical squamous cells of undetermined significance or higher were included. HPV genotype was determined for all samples, and results were stratified by demographics and cytology results. Results: Forty-four unique HPV genotypes were identified from 4,794 samples. Of the 4,241 samples with a genotype identified, the most common genotypes were HPV 16, 18, 31, and 51, with 1,599 (37.7%), 441 (12.2%), 329 (7.8%), and 354 (8.4%), respectively. HPV9 vaccine genotypes made up 73.2% of these genotyped samples. Compared with specimens in which HPV9 vaccine genotypes were not detected, those with a genotype covered by the HPV9 vaccine were from younger women (33 [interquartile range {IQR] 28 to 42] y versus 40 [IQR 32 to 51] y; p < 0.00001). Conclusions: The baseline distribution of HPV genotypes in this largely unvaccinated population indicates that the HPV9 vaccine provides good protection from high-risk HPV infections. Determining the frequency of genotypes causing abnormal cytology in this population post–vaccine implementation will be important to assess efficacy of vaccination and monitor for any potential genotype replacement.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».