Sarcomere length measurement reliability in single myofibrils
Notice bibliographique
Résumé
Sarcomere length non-uniformities occur at all structural levels of skeletal muscles and have been associated with important mechanical properties. Changes in sarcomere length non-uniformities in the nano- and sub-nanometer range have been used to explain muscle properties and contractile mechanisms. Typically, these measurements rely on light microscopy with a limited spatial resolution. One critical aspect in sarcomere length determination is the relatively arbitrary choice of intensity thresholds used to delineate sarcomere structures, such as A-bands or Z-lines. In experiments, these structures are typically distorted, intensity profiles vary, and baselines drift, resulting in asymmetric intensity patterns, causing changes in the centroid location of these structures depending on threshold choice, resulting in changes of sarcomere lengths. The purpose of this study was to determine the changes in (half-) sarcomere lengths associated with small changes in the A-band threshold choice. Sarcomere and half-sarcomere length changes for minute variations in A-band threshold were 28 nm (±28 nm) and 18 nm (±22 nm), respectively, and for the entire feasible range of thresholds across A-bands were 123 nm (±88 nm) and 99 nm (±105 nm), respectively. We conclude from these results that (half-) sarcomere lengths in the nanometer range obtained with light microcopy are noise, and the functional implications associated with such data should be discarded. We suggest that a functional resolution for sarcomere length of 100 nm (0.1 µm) is reasonable and 50 nm (0.05 µm) might be possible under ideal conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,021 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».