Curvivirga aplysinae gen. nov., sp. nov., a marine bacterium isolated from the sea sponge Aplysina fistularis
Notice bibliographique
Résumé
A Gram-stain-negative, strictly aerobic, motile bacterium, designated strain RKSG073T, was isolated from the sea spongeAplysina fistularis, collected off the west coast of San Salvador, The Bahamas. Cells were curved-to-spiral rods with single, bipolar (amphitrichous) flagella, oxidase- and catalase-positive, non-nitrate-reducing and required salt for growth. RKSG073Tgrew optimally at 30–37 °C, pH 6–7, and with 2–3 % (w/v) NaCl. The predominant fatty acids of RKSG073Twere summed feature 8 (C18 : 1ω6cand/or C18 : 1ω7c) and C16 : 0. Major isoprenoid quinones were identified as Q-10 and Q-9. Phylogenetic analyses of nearly complete 16S rRNA genes and genome sequences positioned strain RKSG073Tin a clade with its closest relative Aestuariispira insulae AH-MY2T(92.1 % 16S rRNA gene sequence similarity), which subsequently clustered with Hwanghaeella grinnelliae Gri0909T, Marivibrio halodurans ZC80Tand type species of the genera Kiloniella , Thalassospira and Terasakiella . The DNA G+C content calculated from the genome of RKSG073Twas 42.2 mol%. On the basis of phylogenetic distinctiveness and polyphasic analysis, here we propose that RKSG073T(culture deposit numbers: ATCC collection = TSD-74T, BCCM collection = LMG 29869T) represents the type strain of a novel genus and species within the family Kiloniellaceae , order Rhodospirillales and class Alphaproteobacteria , for which the nameCurvivirga aplysinaegen. nov., sp. nov. is proposed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».