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Enregistrement W3183165891

Dried blood spot (DBS) Collection for SARS-CoV-2 antibodies

2021· article· en· W3183165891 sur OpenAlexaboutno aff
Hans Vandenberghe, C. Naik, J. Ivica, K. Mackett, C. Marcotte, Dipak Patel, A. Girgis-Gabardo, Cynthia Balion

Notice bibliographique

RevueBiopreservation and Biobanking · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBiosimilars and Bioanalytical Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlood collectionBarcodeDried blood spotData collectionMedicineComputer scienceChromatographyMedical emergencyChemistryMathematics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The COVID-19 antibody sub-study of the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA) has been designed to examine the seroprevalence of the SARS-CoV-2 infection from 19,000 participants across Canada over three timeperiods. The largest set will be performed by in-home collection using a dried blood spot (DBS) device. Methods: We evaluated two self-collection devices, Mitra® (Neoteryx) and Velvet™ (Boston Microfluidics), considering cost, delivery, availability, ease of sample collection and return, sample volume, blood fractionation, normalization requirement, hemolysis, and analysis of additional analytes and ease of storage. We developed collection instructions, a quality of collection questionnaire, and a process to ship, return and store the devices. Results: Velvet™ was selected for several reasons. Hand eye coordination was less demanding for collecting drops of blood into a well compared to dropping blood on several microfiber tips for the Mitra®. Normalization for volume collected is needed for both, but hemoglobin interference is not an issue with Velvet™ as blood is fractionated into cell components and plasma. Storage of Velvet™ at -80°C was easier than Mitra® with a unique barcode on each device for scanning and were easily stackable in trays with its rectangular shape and smooth surface. Customized collection kits were made with devices, retractable lancets, gauze, Band-Aids, return pouch and in-structions. Partnership with FedEx and Canada Post provided timely delivery of collection kits and return of devices. An instruction video showing how to collect the sample was prepared and posted on the CLSA website. In the first collection we obtained 3339 devices of the 3803mailed out. Almost all participants completed the collection within 15 minutes, but some did not record the date and time when it was done. Some participants required collection from two fingers and almost all wiped their finger with an alcohol swab. Few participants found the instructions difficult to follow but most had to squeeze their finger to achieve good flow. About one-quarter of devices were underfilled. Conclusion: We were successful in our rapid implementation of DBS collection for the seroprevalence study, but improvements can be made in the participant instructions to achieve an easier and more complete collection using Velvet™.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,093

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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