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Enregistrement W3183478831 · doi:10.1002/mp.15017

SCU‐Net: A deep learning method for segmentation and quantification of breast arterial calcifications on mammograms

2021· article· en· W3183478831 sur OpenAlexaff
Xiaoyuan Guo, W. Charles O’Neill, Brianna L. Vey, Tianen Christopher Yang, Thomas J. Kim, Maryzeh Ghassemi, Ian Pan, Judy Wawira Gichoya, Hari Trivedi, Imon Banerjee

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Imaging and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésJaccard indexMetric (unit)SegmentationArtificial intelligenceContext (archaeology)Pattern recognition (psychology)Computer scienceCorrelationMammographyDigital mammographyMathematicsMedicineBreast cancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose Measurements of breast arterial calcifications (BAC) can offer a personalized, non‐invasive approach to risk‐stratify women for cardiovascular diseases such as heart attack and stroke. We aim to detect and segment breast arterial calcifications in mammograms accurately and suggest novel measurements to quantify detected BAC for future clinical applications. Methods To separate BAC in mammograms, we propose a lightweight fine vessel segmentation method Simple Context U‐Net (SCU‐Net). Due to the large image size of mammograms, we adopt a patch‐based way to train SCU‐Net and obtain the final whole‐image‐size results by stitching patchwise results together. To further quantify calcifications, we test five quantitative metrics to inspect the progression of BAC for subjects: sum of mask probability metric (), sum of mask area metric (), sum of mask intensity metric (), sum of mask area with threshold intensity metric , and sum of mask intensity with threshold X metric . Finally, we demonstrate the ability of the metrics to longitudinally measure calcifications in a group of 26 subjects and evaluate our quantification metrics compared with calcified voxels and calcium mass on breast CT for 10 subjects. Results Our segmentation results are compared with state‐of‐the‐art network architectures based on recall, precision, accuracy, F1 score/Dice score, and Jaccard index evaluation metrics and achieve corresponding values of 0.789, 0.708, 0.997, 0.729, and 0.581 for whole‐image‐size results. The quantification results all show >95% correlation between quantification measures on predicted masks of SCU‐Net as compared to the groundtruth and measurement of calcification on breast CT. For the calcification quantification measurement, our calcification volume (voxels) results yield R 2 ‐correlation values of 0.834, 0.843, 0.832, 0.798, and 0.800 for the metrics, respectively; our calcium mass results yield comparable R 2 ‐correlation values of 0.866, 0.873, 0.840, 0.774, and 0.798 for the same metrics. Conclusions Simple Context U‐Net is a simple method to accurately segment arterial calcification retrospectively on routine mammograms. Quantification of the calcifications based on this segmentation in the retrospective cohort study has sufficient sensitivity to detect the normal progression over time and should be useful for future research and clinical applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,943
Score d'incertitude au seuil0,281

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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