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Enregistrement W3183495504 · doi:10.2196/30401

Machine Learning Approaches to Retrieve High-Quality, Clinically Relevant Evidence From the Biomedical Literature: Systematic Review

2021· review· en· W3183495504 sur OpenAlexaffvenue
Wael Abdelkader, Tamara Navarro, Rick Parrish, Chris Cotoi, Federico Germini, Alfonso Iorio, R. Brian Haynes, Cynthia Lokker

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2021
Typereview
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensMcMaster UniversityImpact
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMachine learningArtificial intelligenceComputer scienceUnsupervised learningQuality (philosophy)Process (computing)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The rapid growth of the biomedical literature makes identifying strong evidence a time-consuming task. Applying machine learning to the process could be a viable solution that limits effort while maintaining accuracy. OBJECTIVE: The goal of the research was to summarize the nature and comparative performance of machine learning approaches that have been applied to retrieve high-quality evidence for clinical consideration from the biomedical literature. METHODS: We conducted a systematic review of studies that applied machine learning techniques to identify high-quality clinical articles in the biomedical literature. Multiple databases were searched to July 2020. Extracted data focused on the applied machine learning model, steps in the development of the models, and model performance. RESULTS: From 3918 retrieved studies, 10 met our inclusion criteria. All followed a supervised machine learning approach and applied, from a limited range of options, a high-quality standard for the training of their model. The results show that machine learning can achieve a sensitivity of 95% while maintaining a high precision of 86%. CONCLUSIONS: Machine learning approaches perform well in retrieving high-quality clinical studies. Performance may improve by applying more sophisticated approaches such as active learning and unsupervised machine learning approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,354
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,637
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Méta-épidémiologie (sens large), Communication savante, Science ouverte, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,412
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3540,637
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0360,010
Bibliométrie0,0010,009
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0130,003
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,799
Tête enseignante GPT0,570
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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