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Enregistrement W3183623681 · doi:10.1007/s11056-021-09865-y

Complexities underlying the breeding and deployment of Dutch elm disease resistant elms

2021· review· en· W3183623681 sur OpenAlexafffund
Juan A. Martín, J. Domínguez, Alejandro Solla, C. M. Brasier, Joan Webber, Alberto Santini, Clara Martínez‐Arias, Louis Bernier, Luis Gil

Notice bibliographique

RevueNew Forests · 2021
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest Insect Ecology and Management
Établissements canadiensUniversité LavalCenter for Northern Studies
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinisterio para la Transición Ecológica y el Reto DemográficoSveriges LantbruksuniversitetGenome CanadaCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean Regional Development FundGenome British ColumbiaGénome QuébecMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaMinisterio de Economía y Competitividad
Mots-clésDutch elm diseaseBiologySoftware deploymentPlant disease resistanceAgroforestryGeographyBotanyComputer scienceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Dutch elm disease (DED) is a vascular wilt disease caused by the pathogens Ophiostoma ulmi and Ophiostoma novo-ulmi with multiple ecological phases including pathogenic (xylem), saprotrophic (bark) and vector (beetle flight and beetle feeding wound) phases. Due to the two DED pandemics during the twentieth century the use of elms in landscape and forest restoration has declined significantly. However new initiatives for elm breeding and restoration are now underway in Europe and North America. Here we discuss complexities in the DED ‘system’ that can lead to unintended consequences during elm breeding and some of the wider options for obtaining durability or ‘field resistance’ in released material, including (1) the phenotypic plasticity of disease levels in resistant cultivars infected by O. novo-ulmi ; (2) shortcomings in test methods when selecting for resistance; (3) the implications of rapid evolutionary changes in current O. novo-ulmi populations for the choice of pathogen inoculum when screening; (4) the possibility of using active resistance to the pathogen in the beetle feeding wound, and low attractiveness of elm cultivars to feeding beetles, in addition to resistance in the xylem; (5) the risk that genes from susceptible and exotic elms be introgressed into resistant cultivars; (6) risks posed by unintentional changes in the host microbiome; and (7) the biosecurity risks posed by resistant elm deployment. In addition, attention needs to be paid to the disease pressures within which resistant elms will be released. In the future, biotechnology may further enhance our understanding of the various resistance processes in elms and our potential to deploy trees with highly durable resistance in elm restoration. Hopefully the different elm resistance processes will prove to be largely under durable, additive, multigenic control. Elm breeding programmes cannot afford to get into the host–pathogen arms races that characterise some agricultural host–pathogen systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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