Identification and Bioinformatic Analysis of the ASAT Gene Family in <i>Oryza staiva</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Rice bran oil is rich in bioactive steryl ferulates that are important not only for seed development, drought stress and lipid metabolism, but also for grain nutrition quality and human healthy. However, its complete compositions and associated metabolic pathways are poorly understood. Arabidopsis thaliana Acyl-CoA Sterol Acyltransferase1 (AtASAT1) is the only one in the superfamily of Membrane-Bound O-Acyltransferases that has ASAT activity, which prefers saturated fatty acyl-CoAs as acyl donors and cycloartenol as the acyl acceptor. Overexpression of AtASAT1 in Arabidopsis results in a strong accumulation of cycloartenol fatty acyl esters accompanied by an increase of the whole steryl esters contents in seeds. Here we present our bioinformatic based analysis data aiming to identify more plant ASAT family members and to in silico study of them in rice. We identified 105 ASAT Family members from public genome database of 10 plant species including Arabidopsis and tomato, and the phylogenetic tree of ASAT family constructed revealed evolutionary relationships of ASAT family members between oil-bearing crop and non-oil-bearing species, and between monocotyledons and dicotyledons. We further investigated into physical and chemical properties of 14 OsASAT proteins, and chromosome distributions, structures and promoter sequences, and expression patterns of corresponding OsASAT genes, providing a solid theoretical basis for further study of the biological functions of OsASAT proteins.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle