MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3183917573 · doi:10.21203/rs.3.rs-715226/v1

Improving Robustness of Automatic Cardiac Function Quantification From Cine Magnetic Resonance Imaging Using Synthetic Image Data

2021· preprint· en· W3183917573 sur OpenAlexfundno aff
Bogdan A. Gheorghiță, Lucian Itu, Puneet Sharma, Constantin Suciu, Jens Wetzl, Christian Geppert, Mohamed Ali Asik Ali, Aaron M. Lee, Stefan K. Piechnik, Stefan Neubauer, Steffen E. Petersen, Jeanette Schulz‐Menger, Teodora Chițiboi

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Imaging and Diagnostics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilCircle Cardiovascular ImagingServierEuropean CommissionBritish Heart FoundationEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésArtificial intelligenceCardiac magnetic resonance imagingConvolutional neural networkSegmentationRobustness (evolution)Computer scienceMagnetic resonance imagingSynthetic dataDeep learningGround truthEjection fractionVentricleData setPattern recognition (psychology)MedicineCardiologyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Although having been the subject of intense research over the years, cardiac function quantification from MRI is still not a fully automatic process in the clinical practice. This is partly due to the shortage of training data covering all relevant cardiovascular disease phenotypes. We propose to synthetically generate short axis CINE MRI using a generative adversarial model to expand the available data sets that consist of predominantly healthy subjects to include more cases with reduced ejection fraction. We introduce a deep learning convolutional neural network (CNN) to predict the end-diastolic volume, end-systolic volume, and implicitly the ejection fraction from cardiac MRI without explicit segmentation. The left ventricle volume predictions were compared to the ground truth values, showing superior accuracy compared to state-of-the-art segmentation methods. We show that using synthetic data generated for pre-training a CNN significantly improves the prediction compared to only using the limited amount of available data, when the training set is imbalanced.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,383
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueResearch Square→Même sujetCardiac Imaging and Diagnostics→Travaux en français237 207→