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Enregistrement W3184840414 · doi:10.17863/cam.70957

Common variants in Alzheimer's disease and risk stratification by polygenic risk scores

2020· article· en· W3184840414 sur OpenAlexfundno aff
Itziar de Rojas, Sonia Moreno–Grau, Niccoló Tesi, Benjamin Grenier‐Boley, Víctor Andrade, Iris E. Jansen, Nancy L. Pedersen, Najada Stringa

Notice bibliographique

RevueidUS (Universidad de Sevilla) · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHealth, Environment, Cognitive Aging
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNIHR Newcastle Biomedical Research CentreEconomic and Social Research CouncilNational Institutes of HealthAmsterdam NeuroscienceAssociazione Italiana Ricerca AlzheimerInstituto de Salud Carlos IIIUK Dementia Research InstituteHjartaverndStichting DioraphteUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustCenter for Innovative MedicineSorbonne UniversitéUniversiteit AntwerpenMedical Research CouncilCorporación Tecnológica de AndalucíaUniversité de BordeauxDemensfondenSahlgrenska UniversitetssjukhusetVetenskapsrådetStockholms Läns LandstingBanco Bilbao Vizcaya ArgentariaNovo NordiskNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesKnut och Alice Wallenbergs StiftelseFundación BBVAMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaBundesministerium für Bildung und ForschungMinisterio de Economía y CompetitividadErasmus Medisch CentrumMinistère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'InnovationGeneralitat de CatalunyaFundación Salud 2000Karolinska InstitutetNational Health and Medical Research CouncilSuomen KulttuurirahastoUniversity of CambridgeZonMwAlzheimer NederlandSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungMinistero della SaluteInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la RechercheVlaamse regeringAlzheimer SocietyNational Institute for Health and Care ResearchNational Research FoundationJunta de AndalucíaUniversität HeidelbergUniversity of BristolUniversity of NottinghamArts and Humanities Research CouncilMinisterstvo Zdravotnictví Ceské RepublikyFondation pour la Recherche sur AlzheimerSocialdepartementetEuropean CommissionNewcastle UniversityGrifolsAXA Research FundWellcome TrustSigrid Juséliuksen SäätiöAlzheimer's SocietyUniversity of SouthamptonMotor Neurone Disease AssociationNIHR Oxford Biomedical Research CentreNational Institute for Social Care and Health ResearchMinisterstvo Školství, Mládeže a TělovýchovyHigher Education Funding Council for WalesDipartimenti di EccellenzaUniversité de LilleCentre hospitalier régional universitaire de LilleEisaiCentro de Investigación Biomédica en Red sobre Enfermedades NeurodegenerativasDevelopment of Innovative Strategies for a Transdisciplinary approach to ALZheimer's diseaseStichting ALS NederlandAlzheimer's AssociationEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsLudwig Boltzmann GesellschaftCardiff UniversityNational Heart, Lung, and Blood InstituteItä-Suomen YliopistoFonds Wetenschappelijk OnderzoekYrjö Jahnssonin SäätiöFundação para a Ciência e a TecnologiaEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchUniversidade de AveiroJuho Vainion SäätiöEuropean Regional Development FundUniversitat de BarcelonaKing's College LondonSeinäjoen KeskussairaalaCentro de Investigación Biomédica en Red Diabetes y Enfermedades Metabólicas AsociadasUniverzita Karlova v Praze
Mots-clésPolygenic risk scoreDiseaseRisk stratificationMedicineGeneticsBiologyDemographyInternal medicineGenotypeGeneSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic discoveries of Alzheimer's disease are the drivers of our understanding, and together with polygenetic risk stratification can contribute towards planning of feasible and efficient preventive and curative clinical trials. We first perform a large genetic association study by merging all available case-control datasets and by-proxy study results (discovery n = 409,435 and validation size n = 58,190). Here, we add six variants associated with Alzheimer's disease risk (near APP, CHRNE, PRKD3/NDUFAF7, PLCG2 and two exonic variants in the SHARPIN gene). Assessment of the polygenic risk score and stratifying by APOE reveal a 4 to 5.5 years difference in median age at onset of Alzheimer's disease patients in APOE ɛ4 carriers. Because of this study, the underlying mechanisms of APP can be studied to refine the amyloid cascade and the polygenic risk score provides a tool to select individuals at high risk of Alzheimer's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,815

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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